Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PFN2P35080 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFN2P35080 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFN2P35080 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PFN2P35080 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PFN2P35080 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PFN2P35080 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PFN2P35080 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PFN2P35080 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PFN2P35080 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PFN2P35080 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PFN2P35080 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PFN2P35080 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PFN2P35080 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFN2P35080 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PFN2P35080 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFN2P35080 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFN2P35080 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFN2P35080 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PFN2P35080 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PFN2P35080 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFN2P35080 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PFN2P35080 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PFN2P35080 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFN2P35080 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFN2P35080 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PFN2P35080 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PFN2P35080 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PFN2P35080 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PFN2P35080 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PFN2P35080 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PFN2P35080 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PFN2P35080 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PFN2P35080 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PFN2P35080 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PFN2P35080 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PFN2P35080 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PFN2P35080 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PFN2P35080 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PFN2P35080 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PFN2P35080 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PFN2P35080 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PFN2P35080 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PFN2P35080 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PFN2P35080 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PFN2P35080 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PFN2P35080 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PFN2P35080 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PFN2P35080 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PFN2P35080 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PFN2P35080 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PFN2P35080 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PFN2P35080 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PFN2P35080 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PFN2P35080 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PFN2P35080 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PFN2P35080 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PFN2P35080 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PFN2P35080 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PFN2P35080 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PFN2P35080 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PFN2P35080 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PFN2P35080 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PFN2P35080 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PFN2P35080 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PFN2P35080 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PFN2P35080 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PFN2P35080 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PFN2P35080 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PFN2P35080 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PFN2P35080 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PFN2P35080 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PFN2P35080 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFN2P35080 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PFN2P35080 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFN2P35080 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFN2P35080 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PFN2P35080 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFN2P35080 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PFN2P35080 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFN2P35080 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PFN2P35080 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFN2P35080 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFN2P35080 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFN2P35080 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFN2P35080 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFN2P35080 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PFN2P35080 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFN2P35080 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFN2P35080 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFN2P35080 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PFN2P35080 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PFN2P35080 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFN2P35080 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFN2P35080 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PFN2P35080 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PFN2P35080 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PFN2P35080 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PFN2P35080 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PFN2P35080 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms