Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXC13P31276 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXC13P31276 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXC13P31276 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXC13P31276 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HOXC13P31276 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HOXC13P31276 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HOXC13P31276 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HOXC13P31276 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXC13P31276 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXC13P31276 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HOXC13P31276 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HOXC13P31276 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HOXC13P31276 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HOXC13P31276 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXC13P31276 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXC13P31276 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HOXC13P31276 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXC13P31276 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXC13P31276 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXC13P31276 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HOXC13P31276 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXC13P31276 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC13P31276 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HOXC13P31276 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXC13P31276 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXC13P31276 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXC13P31276 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXC13P31276 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXC13P31276 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXC13P31276 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXC13P31276 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXC13P31276 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXC13P31276 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXC13P31276 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXC13P31276 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXC13P31276 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC13P31276 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC13P31276 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC13P31276 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXC13P31276 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC13P31276 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC13P31276 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC13P31276 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC13P31276 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC13P31276 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC13P31276 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXC13P31276 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC13P31276 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC13P31276 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC13P31276 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXC13P31276 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC13P31276 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC13P31276 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC13P31276 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC13P31276 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC13P31276 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC13P31276 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC13P31276 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC13P31276 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms