Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
HOXC13P31276 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HOXC13P31276 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HOXC13P31276 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
HOXC13P31276 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HOXC13P31276 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HOXC13P31276 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXC13P31276 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HOXC13P31276 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HOXC13P31276 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HOXC13P31276 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HOXC13P31276 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HOXC13P31276 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HOXC13P31276 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HOXC13P31276 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
HOXC13P31276 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HOXC13P31276 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
HOXC13P31276 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HOXC13P31276 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
HOXC13P31276 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
HOXC13P31276 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HOXC13P31276 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HOXC13P31276 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HOXC13P31276 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HOXC13P31276 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HOXC13P31276 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
HOXC13P31276 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXC13P31276 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXC13P31276 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXC13P31276 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HOXC13P31276 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXC13P31276 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXC13P31276 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXC13P31276 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXC13P31276 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXC13P31276 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXC13P31276 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXC13P31276 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXC13P31276 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXC13P31276 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXC13P31276 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
HOXC13P31276 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HOXC13P31276 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXC13P31276 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HOXC13P31276 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HOXC13P31276 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HOXC13P31276 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
HOXC13P31276 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXC13P31276 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HOXC13P31276 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXC13P31276 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HOXC13P31276 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HOXC13P31276 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HOXC13P31276 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HOXC13P31276 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HOXC13P31276 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HOXC13P31276 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HOXC13P31276 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXC13P31276 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXC13P31276 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXC13P31276 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXC13P31276 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXC13P31276 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXC13P31276 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXC13P31276 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HOXC13P31276 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HOXC13P31276 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HOXC13P31276 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HOXC13P31276 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HOXC13P31276 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HOXC13P31276 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HOXC13P31276 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HOXC13P31276 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXC13P31276 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HOXC13P31276 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HOXC13P31276 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HOXC13P31276 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HOXC13P31276 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HOXC13P31276 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HOXC13P31276 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HOXC13P31276 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HOXC13P31276 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC13P31276 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HOXC13P31276 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HOXC13P31276 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXC13P31276 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HOXC13P31276 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXC13P31276 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HOXC13P31276 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HOXC13P31276 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HOXC13P31276 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HOXC13P31276 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXC13P31276 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HOXC13P31276 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HOXC13P31276 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms