Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDX3P30048 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDX3P30048 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDX3P30048 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDX3P30048 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDX3P30048 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDX3P30048 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDX3P30048 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRDX3P30048 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDX3P30048 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRDX3P30048 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRDX3P30048 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDX3P30048 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDX3P30048 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDX3P30048 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDX3P30048 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDX3P30048 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDX3P30048 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDX3P30048 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDX3P30048 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDX3P30048 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDX3P30048 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDX3P30048 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDX3P30048 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDX3P30048 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRDX3P30048 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRDX3P30048 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDX3P30048 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDX3P30048 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDX3P30048 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRDX3P30048 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRDX3P30048 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRDX3P30048 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRDX3P30048 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRDX3P30048 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDX3P30048 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRDX3P30048 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRDX3P30048 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDX3P30048 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDX3P30048 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDX3P30048 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDX3P30048 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDX3P30048 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRDX3P30048 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRDX3P30048 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRDX3P30048 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDX3P30048 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDX3P30048 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms