Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E2P29084 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E2P29084 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E2P29084 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E2P29084 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2E2P29084 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E2P29084 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2E2P29084 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2E2P29084 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E2P29084 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2E2P29084 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E2P29084 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E2P29084 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E2P29084 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E2P29084 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E2P29084 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E2P29084 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2E2P29084 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2E2P29084 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF2E2P29084 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2E2P29084 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2E2P29084 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2E2P29084 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E2P29084 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2E2P29084 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2E2P29084 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF2E2P29084 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GTF2E2P29084 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E2P29084 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E2P29084 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF2E2P29084 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2E2P29084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2E2P29084 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2E2P29084 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2E2P29084 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2E2P29084 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2E2P29084 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2E2P29084 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2E2P29084 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2E2P29084 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E2P29084 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E2P29084 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2E2P29084 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2E2P29084 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2E2P29084 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2E2P29084 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms