Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CBLN1P23435 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN1P23435 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN1P23435 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBLN1P23435 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBLN1P23435 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBLN1P23435 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBLN1P23435 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBLN1P23435 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBLN1P23435 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CBLN1P23435 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CBLN1P23435 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CBLN1P23435 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN1P23435 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN1P23435 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN1P23435 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN1P23435 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN1P23435 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN1P23435 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBLN1P23435 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBLN1P23435 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBLN1P23435 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBLN1P23435 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBLN1P23435 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBLN1P23435 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CBLN1P23435 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBLN1P23435 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBLN1P23435 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms