Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNAP12004 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCNAP12004 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCNAP12004 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNAP12004 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNAP12004 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNAP12004 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNAP12004 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNAP12004 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNAP12004 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNAP12004 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PCNAP12004 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCNAP12004 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNAP12004 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCNAP12004 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNAP12004 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNAP12004 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNAP12004 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNAP12004 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCNAP12004 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCNAP12004 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNAP12004 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCNAP12004 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNAP12004 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNAP12004 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCNAP12004 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCNAP12004 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCNAP12004 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCNAP12004 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNAP12004 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNAP12004 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCNAP12004 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNAP12004 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNAP12004 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCNAP12004 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCNAP12004 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNAP12004 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNAP12004 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNAP12004 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCNAP12004 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNAP12004 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCNAP12004 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCNAP12004 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCNAP12004 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNAP12004 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNAP12004 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNAP12004 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNAP12004 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNAP12004 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNAP12004 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNAP12004 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNAP12004 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNAP12004 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCNAP12004 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNAP12004 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNAP12004 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNAP12004 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNAP12004 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNAP12004 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNAP12004 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNAP12004 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNAP12004 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNAP12004 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCNAP12004 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNAP12004 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNAP12004 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCNAP12004 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCNAP12004 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNAP12004 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNAP12004 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNAP12004 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNAP12004 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCNAP12004 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCNAP12004 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCNAP12004 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCNAP12004 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNAP12004 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNAP12004 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCNAP12004 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNAP12004 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNAP12004 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNAP12004 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCNAP12004 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCNAP12004 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCNAP12004 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNAP12004 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNAP12004 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCNAP12004 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCNAP12004 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCNAP12004 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCNAP12004 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNAP12004 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNAP12004 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PCNAP12004 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNAP12004 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCNAP12004 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNAP12004 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNAP12004 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCNAP12004 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCNAP12004 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms