Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RALAP11233 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RALAP11233 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RALAP11233 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
RALAP11233 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RALAP11233 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RALAP11233 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RALAP11233 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RALAP11233 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RALAP11233 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RALAP11233 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RALAP11233 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RALAP11233 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RALAP11233 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RALAP11233 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RALAP11233 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RALAP11233 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RALAP11233 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RALAP11233 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RALAP11233 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RALAP11233 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RALAP11233 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RALAP11233 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RALAP11233 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RALAP11233 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RALAP11233 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RALAP11233 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RALAP11233 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RALAP11233 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RALAP11233 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RALAP11233 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RALAP11233 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RALAP11233 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RALAP11233 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RALAP11233 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RALAP11233 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RALAP11233 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RALAP11233 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RALAP11233 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RALAP11233 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RALAP11233 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RALAP11233 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RALAP11233 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RALAP11233 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RALAP11233 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RALAP11233 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RALAP11233 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RALAP11233 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RALAP11233 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RALAP11233 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RALAP11233 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RALAP11233 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RALAP11233 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RALAP11233 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RALAP11233 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RALAP11233 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RALAP11233 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RALAP11233 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RALAP11233 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RALAP11233 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RALAP11233 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RALAP11233 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RALAP11233 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RALAP11233 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RALAP11233 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RALAP11233 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RALAP11233 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RALAP11233 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RALAP11233 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RALAP11233 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RALAP11233 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RALAP11233 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RALAP11233 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RALAP11233 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RALAP11233 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RALAP11233 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RALAP11233 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RALAP11233 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RALAP11233 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
RALAP11233 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RALAP11233 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RALAP11233 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RALAP11233 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RALAP11233 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RALAP11233 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RALAP11233 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RALAP11233 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RALAP11233 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RALAP11233 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RALAP11233 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RALAP11233 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RALAP11233 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RALAP11233 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RALAP11233 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RALAP11233 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RALAP11233 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RALAP11233 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RALAP11233 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RALAP11233 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RALAP11233 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms