Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM17P0DL12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM17P0DL12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM17P0DL12 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM17P0DL12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMIM17P0DL12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM17P0DL12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM17P0DL12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM17P0DL12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMIM17P0DL12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMIM17P0DL12 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMIM17P0DL12 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMIM17P0DL12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMIM17P0DL12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMIM17P0DL12 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM17P0DL12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMIM17P0DL12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM17P0DL12 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM17P0DL12 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM17P0DL12 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM17P0DL12 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMIM17P0DL12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM17P0DL12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM17P0DL12 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM17P0DL12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM17P0DL12 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM17P0DL12 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms