Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CHGBP05060 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CHGBP05060 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHGBP05060 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CHGBP05060 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGBP05060 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CHGBP05060 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CHGBP05060 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CHGBP05060 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CHGBP05060 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CHGBP05060 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CHGBP05060 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHGBP05060 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CHGBP05060 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CHGBP05060 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CHGBP05060 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHGBP05060 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CHGBP05060 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHGBP05060 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHGBP05060 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CHGBP05060 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CHGBP05060 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CHGBP05060 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHGBP05060 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CHGBP05060 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CHGBP05060 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CHGBP05060 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHGBP05060 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CHGBP05060 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CHGBP05060 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CHGBP05060 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHGBP05060 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CHGBP05060 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGBP05060 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHGBP05060 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGBP05060 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGBP05060 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGBP05060 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGBP05060 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGBP05060 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGBP05060 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHGBP05060 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CHGBP05060 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGBP05060 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGBP05060 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGBP05060 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHGBP05060 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGBP05060 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHGBP05060 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHGBP05060 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHGBP05060 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHGBP05060 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHGBP05060 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHGBP05060 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHGBP05060 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHGBP05060 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHGBP05060 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHGBP05060 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHGBP05060 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHGBP05060 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHGBP05060 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHGBP05060 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHGBP05060 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHGBP05060 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHGBP05060 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHGBP05060 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGBP05060 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGBP05060 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHGBP05060 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGBP05060 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGBP05060 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHGBP05060 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHGBP05060 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHGBP05060 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGBP05060 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGBP05060 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHGBP05060 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHGBP05060 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHGBP05060 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHGBP05060 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHGBP05060 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHGBP05060 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHGBP05060 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHGBP05060 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGBP05060 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHGBP05060 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHGBP05060 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CHGBP05060 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CHGBP05060 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHGBP05060 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHGBP05060 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGBP05060 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHGBP05060 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHGBP05060 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms