Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYNGR4O95473 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNGR4O95473 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNGR4O95473 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNGR4O95473 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNGR4O95473 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNGR4O95473 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNGR4O95473 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGR4O95473 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNGR4O95473 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNGR4O95473 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGR4O95473 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGR4O95473 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGR4O95473 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGR4O95473 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGR4O95473 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGR4O95473 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGR4O95473 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGR4O95473 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNGR4O95473 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNGR4O95473 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNGR4O95473 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNGR4O95473 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGR4O95473 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNGR4O95473 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNGR4O95473 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNGR4O95473 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNGR4O95473 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNGR4O95473 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNGR4O95473 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNGR4O95473 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNGR4O95473 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNGR4O95473 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGR4O95473 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNGR4O95473 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNGR4O95473 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNGR4O95473 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGR4O95473 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNGR4O95473 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNGR4O95473 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNGR4O95473 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNGR4O95473 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGR4O95473 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYNGR4O95473 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNGR4O95473 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYNGR4O95473 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYNGR4O95473 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNGR4O95473 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms