Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CRCPO75575 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRCPO75575 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRCPO75575 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRCPO75575 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRCPO75575 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRCPO75575 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRCPO75575 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRCPO75575 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CRCPO75575 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRCPO75575 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRCPO75575 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRCPO75575 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRCPO75575 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRCPO75575 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRCPO75575 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRCPO75575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRCPO75575 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRCPO75575 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRCPO75575 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRCPO75575 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRCPO75575 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CRCPO75575 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRCPO75575 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRCPO75575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRCPO75575 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRCPO75575 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRCPO75575 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRCPO75575 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRCPO75575 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRCPO75575 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRCPO75575 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRCPO75575 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRCPO75575 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRCPO75575 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRCPO75575 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRCPO75575 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRCPO75575 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRCPO75575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRCPO75575 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRCPO75575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRCPO75575 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRCPO75575 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRCPO75575 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRCPO75575 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRCPO75575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRCPO75575 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRCPO75575 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRCPO75575 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRCPO75575 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRCPO75575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRCPO75575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRCPO75575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRCPO75575 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRCPO75575 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRCPO75575 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRCPO75575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRCPO75575 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRCPO75575 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRCPO75575 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRCPO75575 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRCPO75575 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRCPO75575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRCPO75575 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRCPO75575 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRCPO75575 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRCPO75575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRCPO75575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRCPO75575 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRCPO75575 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRCPO75575 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRCPO75575 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRCPO75575 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRCPO75575 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRCPO75575 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRCPO75575 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRCPO75575 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRCPO75575 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRCPO75575 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRCPO75575 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRCPO75575 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRCPO75575 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRCPO75575 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRCPO75575 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRCPO75575 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRCPO75575 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRCPO75575 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRCPO75575 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRCPO75575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRCPO75575 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRCPO75575 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRCPO75575 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRCPO75575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRCPO75575 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRCPO75575 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRCPO75575 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRCPO75575 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRCPO75575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRCPO75575 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRCPO75575 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms