Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNX3O60493 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNX3O60493 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNX3O60493 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX3O60493 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX3O60493 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX3O60493 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX3O60493 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX3O60493 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX3O60493 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX3O60493 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX3O60493 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX3O60493 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX3O60493 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX3O60493 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX3O60493 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX3O60493 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX3O60493 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX3O60493 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX3O60493 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX3O60493 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX3O60493 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX3O60493 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX3O60493 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX3O60493 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX3O60493 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX3O60493 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX3O60493 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX3O60493 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX3O60493 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX3O60493 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX3O60493 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX3O60493 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX3O60493 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX3O60493 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX3O60493 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX3O60493 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX3O60493 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX3O60493 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX3O60493 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX3O60493 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX3O60493 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX3O60493 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX3O60493 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX3O60493 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX3O60493 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX3O60493 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX3O60493 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX3O60493 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX3O60493 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX3O60493 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX3O60493 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX3O60493 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX3O60493 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX3O60493 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX3O60493 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX3O60493 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX3O60493 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX3O60493 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX3O60493 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX3O60493 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX3O60493 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX3O60493 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX3O60493 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX3O60493 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX3O60493 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX3O60493 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX3O60493 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX3O60493 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX3O60493 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX3O60493 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX3O60493 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNX3O60493 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX3O60493 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX3O60493 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX3O60493 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNX3O60493 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX3O60493 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX3O60493 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX3O60493 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX3O60493 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNX3O60493 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNX3O60493 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNX3O60493 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNX3O60493 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX3O60493 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNX3O60493 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX3O60493 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX3O60493 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX3O60493 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX3O60493 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX3O60493 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX3O60493 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX3O60493 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX3O60493 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX3O60493 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX3O60493 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX3O60493 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX3O60493 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX3O60493 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms