Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SEMA3EO15041 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SEMA3EO15041 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SEMA3EO15041 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SEMA3EO15041 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SEMA3EO15041 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SEMA3EO15041 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SEMA3EO15041 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SEMA3EO15041 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SEMA3EO15041 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SEMA3EO15041 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SEMA3EO15041 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SEMA3EO15041 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SEMA3EO15041 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SEMA3EO15041 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SEMA3EO15041 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SEMA3EO15041 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SEMA3EO15041 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SEMA3EO15041 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SEMA3EO15041 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SEMA3EO15041 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SEMA3EO15041 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SEMA3EO15041 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SEMA3EO15041 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SEMA3EO15041 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SEMA3EO15041 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SEMA3EO15041 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SEMA3EO15041 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SEMA3EO15041 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SEMA3EO15041 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SEMA3EO15041 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SEMA3EO15041 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SEMA3EO15041 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SEMA3EO15041 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SEMA3EO15041 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SEMA3EO15041 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SEMA3EO15041 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SEMA3EO15041 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SEMA3EO15041 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SEMA3EO15041 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SEMA3EO15041 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SEMA3EO15041 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SEMA3EO15041 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SEMA3EO15041 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SEMA3EO15041 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SEMA3EO15041 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SEMA3EO15041 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SEMA3EO15041 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SEMA3EO15041 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SEMA3EO15041 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SEMA3EO15041 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SEMA3EO15041 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SEMA3EO15041 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SEMA3EO15041 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEMA3EO15041 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SEMA3EO15041 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SEMA3EO15041 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SEMA3EO15041 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SEMA3EO15041 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SEMA3EO15041 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SEMA3EO15041 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SEMA3EO15041 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEMA3EO15041 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEMA3EO15041 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEMA3EO15041 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEMA3EO15041 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.3 ms