Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SEMA3EO15041 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SEMA3EO15041 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SEMA3EO15041 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SEMA3EO15041 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SEMA3EO15041 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
SEMA3EO15041 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
SEMA3EO15041 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SEMA3EO15041 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SEMA3EO15041 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SEMA3EO15041 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SEMA3EO15041 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SEMA3EO15041 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SEMA3EO15041 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SEMA3EO15041 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SEMA3EO15041 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SEMA3EO15041 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SEMA3EO15041 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SEMA3EO15041 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SEMA3EO15041 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
SEMA3EO15041 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SEMA3EO15041 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SEMA3EO15041 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SEMA3EO15041 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SEMA3EO15041 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SEMA3EO15041 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SEMA3EO15041 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SEMA3EO15041 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SEMA3EO15041 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SEMA3EO15041 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SEMA3EO15041 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SEMA3EO15041 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SEMA3EO15041 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SEMA3EO15041 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SEMA3EO15041 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SEMA3EO15041 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SEMA3EO15041 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SEMA3EO15041 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SEMA3EO15041 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SEMA3EO15041 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SEMA3EO15041 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SEMA3EO15041 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SEMA3EO15041 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
SEMA3EO15041 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SEMA3EO15041 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SEMA3EO15041 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SEMA3EO15041 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SEMA3EO15041 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SEMA3EO15041 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SEMA3EO15041 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SEMA3EO15041 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SEMA3EO15041 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SEMA3EO15041 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SEMA3EO15041 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SEMA3EO15041 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SEMA3EO15041 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SEMA3EO15041 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SEMA3EO15041 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SEMA3EO15041 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SEMA3EO15041 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SEMA3EO15041 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SEMA3EO15041 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SEMA3EO15041 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SEMA3EO15041 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SEMA3EO15041 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SEMA3EO15041 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SEMA3EO15041 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SEMA3EO15041 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SEMA3EO15041 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SEMA3EO15041 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SEMA3EO15041 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SEMA3EO15041 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SEMA3EO15041 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SEMA3EO15041 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SEMA3EO15041 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SEMA3EO15041 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SEMA3EO15041 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SEMA3EO15041 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SEMA3EO15041 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SEMA3EO15041 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SEMA3EO15041 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SEMA3EO15041 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SEMA3EO15041 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SEMA3EO15041 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SEMA3EO15041 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SEMA3EO15041 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SEMA3EO15041 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SEMA3EO15041 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SEMA3EO15041 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SEMA3EO15041 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SEMA3EO15041 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SEMA3EO15041 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SEMA3EO15041 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SEMA3EO15041 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SEMA3EO15041 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SEMA3EO15041 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SEMA3EO15041 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SEMA3EO15041 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SEMA3EO15041 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SEMA3EO15041 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms