Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASKO14936 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASKO14936 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASKO14936 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASKO14936 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASKO14936 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASKO14936 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASKO14936 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASKO14936 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKO14936 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKO14936 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKO14936 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKO14936 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKO14936 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKO14936 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKO14936 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKO14936 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKO14936 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKO14936 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKO14936 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKO14936 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKO14936 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKO14936 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKO14936 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKO14936 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKO14936 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKO14936 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKO14936 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASKO14936 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASKO14936 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASKO14936 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASKO14936 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CASKO14936 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKO14936 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASKO14936 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASKO14936 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASKO14936 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASKO14936 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASKO14936 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASKO14936 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASKO14936 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASKO14936 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASKO14936 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASKO14936 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASKO14936 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASKO14936 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASKO14936 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASKO14936 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKO14936 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASKO14936 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASKO14936 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASKO14936 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASKO14936 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASKO14936 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASKO14936 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKO14936 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKO14936 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKO14936 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASKO14936 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASKO14936 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASKO14936 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASKO14936 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASKO14936 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASKO14936 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASKO14936 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASKO14936 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASKO14936 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASKO14936 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASKO14936 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASKO14936 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASKO14936 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKO14936 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKO14936 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKO14936 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKO14936 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKO14936 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKO14936 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKO14936 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKO14936 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKO14936 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKO14936 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKO14936 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKO14936 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKO14936 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKO14936 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKO14936 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKO14936 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKO14936 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKO14936 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKO14936 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASKO14936 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASKO14936 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASKO14936 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASKO14936 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASKO14936 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASKO14936 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASKO14936 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASKO14936 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASKO14936 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASKO14936 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms