Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCKDKO14874 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCKDKO14874 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCKDKO14874 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCKDKO14874 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCKDKO14874 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BCKDKO14874 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BCKDKO14874 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCKDKO14874 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCKDKO14874 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCKDKO14874 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCKDKO14874 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCKDKO14874 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCKDKO14874 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCKDKO14874 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCKDKO14874 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCKDKO14874 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCKDKO14874 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCKDKO14874 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCKDKO14874 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCKDKO14874 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCKDKO14874 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCKDKO14874 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCKDKO14874 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCKDKO14874 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCKDKO14874 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BCKDKO14874 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCKDKO14874 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCKDKO14874 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCKDKO14874 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCKDKO14874 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCKDKO14874 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCKDKO14874 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCKDKO14874 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCKDKO14874 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms