Protein–RNA interactions for Protein: O00400

SLC33A1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC33A1O00400 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC33A1O00400 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC33A1O00400 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC33A1O00400 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC33A1O00400 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC33A1O00400 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC33A1O00400 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC33A1O00400 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC33A1O00400 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC33A1O00400 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC33A1O00400 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC33A1O00400 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC33A1O00400 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC33A1O00400 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC33A1O00400 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC33A1O00400 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC33A1O00400 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC33A1O00400 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC33A1O00400 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC33A1O00400 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC33A1O00400 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC33A1O00400 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC33A1O00400 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC33A1O00400 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC33A1O00400 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC33A1O00400 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC33A1O00400 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC33A1O00400 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC33A1O00400 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC33A1O00400 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC33A1O00400 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC33A1O00400 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC33A1O00400 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC33A1O00400 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC33A1O00400 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC33A1O00400 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC33A1O00400 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC33A1O00400 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC33A1O00400 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC33A1O00400 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC33A1O00400 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC33A1O00400 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC33A1O00400 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC33A1O00400 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC33A1O00400 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC33A1O00400 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC33A1O00400 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC33A1O00400 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC33A1O00400 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms