Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QQQ9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QQQ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QQQ9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QQQ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QQQ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QQQ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QQQ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QQQ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QQQ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QQQ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QQQ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QQQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QQQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
J3QQQ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
J3QQQ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
J3QQQ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
J3QQQ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
J3QQQ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QQQ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
J3QQQ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3QQQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
J3QQQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3QQQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3QQQ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
J3QQQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
J3QQQ9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3QQQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3QQQ9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
J3QQQ9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
J3QQQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
J3QQQ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
J3QQQ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3QQQ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3QQQ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
J3QQQ9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
J3QQQ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
J3QQQ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
J3QQQ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
J3QQQ9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
J3QQQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QQQ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
J3QQQ9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
J3QQQ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3QQQ9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QQQ9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QQQ9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QQQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3QQQ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QQQ9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QQQ9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3QQQ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3QQQ9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QQQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QQQ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QQQ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QQQ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QQQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QQQ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QQQ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QQQ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QQQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QQQ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QQQ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QQQ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QQQ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QQQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QQQ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QQQ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3QQQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3QQQ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3QQQ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3QQQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3QQQ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3QQQ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3QQQ9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3QQQ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3QQQ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3QQQ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3QQQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3QQQ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3QQQ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3QQQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3QQQ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3QQQ9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3QQQ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3QQQ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3QQQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3QQQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3QQQ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3QQQ9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3QQQ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3QQQ9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3QQQ9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QQQ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QQQ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QQQ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QQQ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QQQ9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QQQ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms