Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABARAPH6UMI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABARAPH6UMI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABARAPH6UMI1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABARAPH6UMI1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABARAPH6UMI1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABARAPH6UMI1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABARAPH6UMI1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABARAPH6UMI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABARAPH6UMI1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABARAPH6UMI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABARAPH6UMI1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABARAPH6UMI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABARAPH6UMI1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABARAPH6UMI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABARAPH6UMI1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABARAPH6UMI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABARAPH6UMI1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABARAPH6UMI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABARAPH6UMI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABARAPH6UMI1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABARAPH6UMI1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABARAPH6UMI1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABARAPH6UMI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABARAPH6UMI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABARAPH6UMI1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABARAPH6UMI1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABARAPH6UMI1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABARAPH6UMI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABARAPH6UMI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABARAPH6UMI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABARAPH6UMI1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABARAPH6UMI1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABARAPH6UMI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABARAPH6UMI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABARAPH6UMI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABARAPH6UMI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABARAPH6UMI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABARAPH6UMI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABARAPH6UMI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GABARAPH6UMI1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPH6UMI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABARAPH6UMI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABARAPH6UMI1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABARAPH6UMI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABARAPH6UMI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABARAPH6UMI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPH6UMI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABARAPH6UMI1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABARAPH6UMI1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPH6UMI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABARAPH6UMI1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABARAPH6UMI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABARAPH6UMI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms