Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC2LH3BP13 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC2LH3BP13 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC2LH3BP13 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC2LH3BP13 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC2LH3BP13 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC2LH3BP13 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC2LH3BP13 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC2LH3BP13 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC2LH3BP13 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC2LH3BP13 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC2LH3BP13 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC2LH3BP13 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAPPC2LH3BP13 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC2LH3BP13 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC2LH3BP13 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC2LH3BP13 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC2LH3BP13 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC2LH3BP13 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC2LH3BP13 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC2LH3BP13 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC2LH3BP13 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms