Protein–RNA interactions for Protein: B1AJZ1

C1orf196, Putative uncharacterized protein C1orf196, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf196B1AJZ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf196B1AJZ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf196B1AJZ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf196B1AJZ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf196B1AJZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf196B1AJZ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf196B1AJZ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf196B1AJZ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf196B1AJZ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf196B1AJZ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf196B1AJZ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf196B1AJZ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf196B1AJZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf196B1AJZ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf196B1AJZ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf196B1AJZ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf196B1AJZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf196B1AJZ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf196B1AJZ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf196B1AJZ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1orf196B1AJZ1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1orf196B1AJZ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1orf196B1AJZ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf196B1AJZ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf196B1AJZ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1orf196B1AJZ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf196B1AJZ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf196B1AJZ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf196B1AJZ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms