Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABRR3A8MPY1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRR3A8MPY1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABRR3A8MPY1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABRR3A8MPY1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABRR3A8MPY1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRR3A8MPY1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABRR3A8MPY1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABRR3A8MPY1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABRR3A8MPY1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABRR3A8MPY1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABRR3A8MPY1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABRR3A8MPY1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRR3A8MPY1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR3A8MPY1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR3A8MPY1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR3A8MPY1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABRR3A8MPY1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABRR3A8MPY1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRR3A8MPY1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABRR3A8MPY1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABRR3A8MPY1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABRR3A8MPY1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRR3A8MPY1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRR3A8MPY1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRR3A8MPY1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRR3A8MPY1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRR3A8MPY1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRR3A8MPY1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABRR3A8MPY1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABRR3A8MPY1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GABRR3A8MPY1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GABRR3A8MPY1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRR3A8MPY1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRR3A8MPY1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRR3A8MPY1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRR3A8MPY1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRR3A8MPY1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABRR3A8MPY1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRR3A8MPY1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRR3A8MPY1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRR3A8MPY1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRR3A8MPY1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABRR3A8MPY1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRR3A8MPY1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABRR3A8MPY1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABRR3A8MPY1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms