Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPN8A6NHC0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN8A6NHC0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPN8A6NHC0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN8A6NHC0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPN8A6NHC0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CAPN8A6NHC0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPN8A6NHC0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN8A6NHC0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN8A6NHC0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN8A6NHC0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN8A6NHC0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPN8A6NHC0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN8A6NHC0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN8A6NHC0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN8A6NHC0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN8A6NHC0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN8A6NHC0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN8A6NHC0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN8A6NHC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN8A6NHC0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN8A6NHC0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN8A6NHC0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN8A6NHC0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN8A6NHC0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN8A6NHC0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN8A6NHC0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN8A6NHC0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN8A6NHC0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN8A6NHC0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN8A6NHC0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN8A6NHC0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN8A6NHC0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAPN8A6NHC0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAPN8A6NHC0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAPN8A6NHC0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAPN8A6NHC0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAPN8A6NHC0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAPN8A6NHC0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN8A6NHC0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAPN8A6NHC0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN8A6NHC0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN8A6NHC0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN8A6NHC0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN8A6NHC0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN8A6NHC0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN8A6NHC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN8A6NHC0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAPN8A6NHC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms