Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNDIG1LA6NDD5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNDIG1LA6NDD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNDIG1LA6NDD5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNDIG1LA6NDD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNDIG1LA6NDD5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNDIG1LA6NDD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNDIG1LA6NDD5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNDIG1LA6NDD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNDIG1LA6NDD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNDIG1LA6NDD5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNDIG1LA6NDD5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNDIG1LA6NDD5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNDIG1LA6NDD5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNDIG1LA6NDD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNDIG1LA6NDD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNDIG1LA6NDD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNDIG1LA6NDD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNDIG1LA6NDD5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNDIG1LA6NDD5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNDIG1LA6NDD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNDIG1LA6NDD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYNDIG1LA6NDD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNDIG1LA6NDD5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNDIG1LA6NDD5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNDIG1LA6NDD5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNDIG1LA6NDD5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNDIG1LA6NDD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNDIG1LA6NDD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNDIG1LA6NDD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNDIG1LA6NDD5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNDIG1LA6NDD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNDIG1LA6NDD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNDIG1LA6NDD5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNDIG1LA6NDD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNDIG1LA6NDD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYNDIG1LA6NDD5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYNDIG1LA6NDD5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms