Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CFAP69A5D8W1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP69A5D8W1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP69A5D8W1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CFAP69A5D8W1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CFAP69A5D8W1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CFAP69A5D8W1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP69A5D8W1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP69A5D8W1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CFAP69A5D8W1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP69A5D8W1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP69A5D8W1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP69A5D8W1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP69A5D8W1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP69A5D8W1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP69A5D8W1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP69A5D8W1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP69A5D8W1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP69A5D8W1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP69A5D8W1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP69A5D8W1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFAP69A5D8W1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFAP69A5D8W1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CFAP69A5D8W1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP69A5D8W1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFAP69A5D8W1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP69A5D8W1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFAP69A5D8W1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP69A5D8W1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP69A5D8W1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CFAP69A5D8W1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CFAP69A5D8W1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFAP69A5D8W1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP69A5D8W1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CFAP69A5D8W1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms