Protein–RNA interactions for Protein: A4QPH2

PI4KAP2, Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP2A4QPH2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PI4KAP2A4QPH2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PI4KAP2A4QPH2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PI4KAP2A4QPH2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PI4KAP2A4QPH2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PI4KAP2A4QPH2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PI4KAP2A4QPH2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PI4KAP2A4QPH2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PI4KAP2A4QPH2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PI4KAP2A4QPH2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PI4KAP2A4QPH2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PI4KAP2A4QPH2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PI4KAP2A4QPH2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PI4KAP2A4QPH2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PI4KAP2A4QPH2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PI4KAP2A4QPH2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PI4KAP2A4QPH2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PI4KAP2A4QPH2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PI4KAP2A4QPH2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PI4KAP2A4QPH2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PI4KAP2A4QPH2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PI4KAP2A4QPH2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PI4KAP2A4QPH2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PI4KAP2A4QPH2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PI4KAP2A4QPH2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PI4KAP2A4QPH2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PI4KAP2A4QPH2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PI4KAP2A4QPH2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PI4KAP2A4QPH2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PI4KAP2A4QPH2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PI4KAP2A4QPH2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PI4KAP2A4QPH2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PI4KAP2A4QPH2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PI4KAP2A4QPH2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PI4KAP2A4QPH2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PI4KAP2A4QPH2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PI4KAP2A4QPH2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PI4KAP2A4QPH2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PI4KAP2A4QPH2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PI4KAP2A4QPH2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PI4KAP2A4QPH2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PI4KAP2A4QPH2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PI4KAP2A4QPH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PI4KAP2A4QPH2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PI4KAP2A4QPH2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PI4KAP2A4QPH2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PI4KAP2A4QPH2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PI4KAP2A4QPH2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PI4KAP2A4QPH2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PI4KAP2A4QPH2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PI4KAP2A4QPH2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PI4KAP2A4QPH2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PI4KAP2A4QPH2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PI4KAP2A4QPH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PI4KAP2A4QPH2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PI4KAP2A4QPH2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PI4KAP2A4QPH2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PI4KAP2A4QPH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PI4KAP2A4QPH2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PI4KAP2A4QPH2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PI4KAP2A4QPH2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PI4KAP2A4QPH2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PI4KAP2A4QPH2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PI4KAP2A4QPH2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PI4KAP2A4QPH2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PI4KAP2A4QPH2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PI4KAP2A4QPH2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PI4KAP2A4QPH2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PI4KAP2A4QPH2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PI4KAP2A4QPH2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PI4KAP2A4QPH2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PI4KAP2A4QPH2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PI4KAP2A4QPH2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PI4KAP2A4QPH2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PI4KAP2A4QPH2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PI4KAP2A4QPH2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PI4KAP2A4QPH2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PI4KAP2A4QPH2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PI4KAP2A4QPH2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PI4KAP2A4QPH2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PI4KAP2A4QPH2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PI4KAP2A4QPH2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PI4KAP2A4QPH2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PI4KAP2A4QPH2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PI4KAP2A4QPH2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PI4KAP2A4QPH2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PI4KAP2A4QPH2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms