Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1V1

IGHV3-21, Immunoglobulin heavy variable 3-21, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV3-21A0A0B4J1V1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV3-21A0A0B4J1V1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV3-21A0A0B4J1V1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV3-21A0A0B4J1V1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV3-21A0A0B4J1V1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-21A0A0B4J1V1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-21A0A0B4J1V1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-21A0A0B4J1V1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-21A0A0B4J1V1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-21A0A0B4J1V1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-21A0A0B4J1V1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-21A0A0B4J1V1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-21A0A0B4J1V1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-21A0A0B4J1V1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGHV3-21A0A0B4J1V1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-21A0A0B4J1V1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-21A0A0B4J1V1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-21A0A0B4J1V1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-21A0A0B4J1V1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-21A0A0B4J1V1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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