Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms