Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HAPLN3Q96S86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HAPLN3Q96S86 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms