RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356489.9

BCKDHB-202, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-202ENST00000356489 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.47■■■■■ 6.63
BCKDHB-202ENST00000356489 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50■■■■■ 5.59
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCC9O60706 1549 aa48.18■■■■■ 5.3
BCKDHB-202ENST00000356489 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
BCKDHB-202ENST00000356489 NACADO15069 1562 aa46.77■■■■■ 5.08
BCKDHB-202ENST00000356489 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.76■■■■■ 5.08
BCKDHB-202ENST00000356489 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.74■■■■■ 5.07
BCKDHB-202ENST00000356489 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.71■■■■■ 5.07
BCKDHB-202ENST00000356489 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.66■■■■■ 5.06
BCKDHB-202ENST00000356489 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.82■■■■■ 4.92
BCKDHB-202ENST00000356489 SCRIBQ14160 1630 aa45.64■■■■■ 4.9
BCKDHB-202ENST00000356489 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.31■■■■■ 4.84
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BCKDHB-202ENST00000356489 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.93■■■■■ 4.78
BCKDHB-202ENST00000356489 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
BCKDHB-202ENST00000356489 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.92■■■■■ 4.62
BCKDHB-202ENST00000356489 SMARCA4P51532 1647 aa43.73■■■■■ 4.59
BCKDHB-202ENST00000356489 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
BCKDHB-202ENST00000356489 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.68■■■■■ 4.58
BCKDHB-202ENST00000356489 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.62■■■■■ 4.57
BCKDHB-202ENST00000356489 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.55■■■■■ 4.56
BCKDHB-202ENST00000356489 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.3■■■■■ 4.52
BCKDHB-202ENST00000356489 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.25■■■■■ 4.51
BCKDHB-202ENST00000356489 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
BCKDHB-202ENST00000356489 SMARCA2P51531 1590 aa43.24■■■■■ 4.51
BCKDHB-202ENST00000356489 WIZO95785 1651 aa43.16■■■■■ 4.5
BCKDHB-202ENST00000356489 NCAPD3P42695 1498 aa43.12■■■■■ 4.49
BCKDHB-202ENST00000356489 HMGXB3Q12766 1538 aa43.02■■■■■ 4.48
BCKDHB-202ENST00000356489 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
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BCKDHB-202ENST00000356489 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
BCKDHB-202ENST00000356489 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.16■■■■■ 4.34
BCKDHB-202ENST00000356489 NESP48681 1621 aa41.93■■■■■ 4.3
BCKDHB-202ENST00000356489 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.92■■■■■ 4.3
BCKDHB-202ENST00000356489 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.86■■■■■ 4.29
BCKDHB-202ENST00000356489 CFTRP13569 1480 aa41.8■■■■■ 4.28
BCKDHB-202ENST00000356489 PRDM2Q13029 1718 aa41.72■■■■■ 4.27
BCKDHB-202ENST00000356489 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.55■■■■■ 4.24
BCKDHB-202ENST00000356489 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.52■■■■■ 4.24
BCKDHB-202ENST00000356489 ERCC6Q03468 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
BCKDHB-202ENST00000356489 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.42■■■■■ 4.22
BCKDHB-202ENST00000356489 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.3■■■■■ 4.2
BCKDHB-202ENST00000356489 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
BCKDHB-202ENST00000356489 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.11■■■■■ 4.17
BCKDHB-202ENST00000356489 WDR62O43379 1518 aa41.01■■■■■ 4.16
BCKDHB-202ENST00000356489 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
BCKDHB-202ENST00000356489 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.89■■■■■ 4.14
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCC8Q09428 1581 aa40.87■■■■■ 4.13
BCKDHB-202ENST00000356489 TOPBP1Q92547 1522 aa40.86■■■■■ 4.13
BCKDHB-202ENST00000356489 CUX1P39880 1505 aa40.81■■■■■ 4.12
BCKDHB-202ENST00000356489 CUX2O14529 1486 aa40.79■■■■■ 4.12
BCKDHB-202ENST00000356489 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
BCKDHB-202ENST00000356489 SYNJ1O43426 1573 aa40.7■■■■■ 4.11
BCKDHB-202ENST00000356489 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.68■■■■■ 4.1
BCKDHB-202ENST00000356489 TOP2BQ02880 1626 aa40.66■■■■■ 4.1
BCKDHB-202ENST00000356489 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
BCKDHB-202ENST00000356489 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.55■■■■■ 4.08
BCKDHB-202ENST00000356489 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
BCKDHB-202ENST00000356489 IFT140Q96RY7 1462 aa40.4■■■■■ 4.06
BCKDHB-202ENST00000356489 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.36■■■■■ 4.05
BCKDHB-202ENST00000356489 SOGA1O94964 1423 aa40.34■■■■■ 4.05
BCKDHB-202ENST00000356489 WDR97A6NE52 1622 aa40.31■■■■■ 4.04
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.19■■■■■ 4.02
BCKDHB-202ENST00000356489 TRIM41Q8WV44 630 aa40.14■■■■■ 4.02
BCKDHB-202ENST00000356489 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
BCKDHB-202ENST00000356489 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.13■■■■■ 4.01
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.05■■■■■ 4
BCKDHB-202ENST00000356489 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
BCKDHB-202ENST00000356489 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
BCKDHB-202ENST00000356489 PBRM1Q86U86 1689 aa39.93■■■■□ 3.98
BCKDHB-202ENST00000356489 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.91■■■■□ 3.98
BCKDHB-202ENST00000356489 GRIN2BQ13224 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
BCKDHB-202ENST00000356489 KIF27Q86VH2 1401 aa39.8■■■■□ 3.96
BCKDHB-202ENST00000356489 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.72■■■■□ 3.95
BCKDHB-202ENST00000356489 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.72■■■■□ 3.95
BCKDHB-202ENST00000356489 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.69■■■■□ 3.94
BCKDHB-202ENST00000356489 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
BCKDHB-202ENST00000356489 ADAMTS12P58397 1594 aa39.59■■■■□ 3.93
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BCKDHB-202ENST00000356489 CHD1O14646 1710 aa39.56■■■■□ 3.92
BCKDHB-202ENST00000356489 CUL7Q14999 1698 aa39.53■■■■□ 3.92
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BCKDHB-202ENST00000356489 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.34■■■■□ 3.89
BCKDHB-202ENST00000356489 GRIN2AQ12879 1464 aa39.33■■■■□ 3.89
BCKDHB-202ENST00000356489 FBLN2P98095 1184 aa39.32■■■■□ 3.89
BCKDHB-202ENST00000356489 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
BCKDHB-202ENST00000356489 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
BCKDHB-202ENST00000356489 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.3■■■■□ 3.88
BCKDHB-202ENST00000356489 PRXQ9BXM0 1461 aa39.26■■■■□ 3.88
BCKDHB-202ENST00000356489 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.21■■■■□ 3.87
BCKDHB-202ENST00000356489 CEP170Q5SW79 1584 aa39.17■■■■□ 3.86
BCKDHB-202ENST00000356489 OSCARQ8IYS5 282 aa39.14■■■■□ 3.86
BCKDHB-202ENST00000356489 KIF21BO75037 1637 aa39.13■■■■□ 3.85
BCKDHB-202ENST00000356489 NUP160Q12769 1436 aa39.12■■■■□ 3.85
BCKDHB-202ENST00000356489 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.07■■■■□ 3.84
BCKDHB-202ENST00000356489 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.95■■■■□ 3.83
BCKDHB-202ENST00000356489 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.89■■■■□ 3.82
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