RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568449.5

EME2-205, Transcript of essential meiotic structure-specific endonuclease subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EME2, Length 1,234 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2-205ENST00000568449 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.51■■■■■ 6.8
EME2-205ENST00000568449 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.03■■■■■ 5.76
EME2-205ENST00000568449 ABCC9O60706 1549 aa50.15■■■■■ 5.62
EME2-205ENST00000568449 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.28■■■■■ 5.32
EME2-205ENST00000568449 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.15■■■■■ 5.3
EME2-205ENST00000568449 NACADO15069 1562 aa48.09■■■■■ 5.29
EME2-205ENST00000568449 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
EME2-205ENST00000568449 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.78■■■■■ 5.24
EME2-205ENST00000568449 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.56■■■■■ 5.2
EME2-205ENST00000568449 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.11
EME2-205ENST00000568449 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.9■■■■■ 5.1
EME2-205ENST00000568449 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.67■■■■■ 5.06
EME2-205ENST00000568449 SCRIBQ14160 1630 aa46.62■■■■■ 5.05
EME2-205ENST00000568449 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.98
EME2-205ENST00000568449 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.17■■■■■ 4.98
EME2-205ENST00000568449 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
EME2-205ENST00000568449 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.29■■■■■ 4.84
EME2-205ENST00000568449 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.07■■■■■ 4.81
EME2-205ENST00000568449 SMARCA4P51532 1647 aa44.58■■■■■ 4.73
EME2-205ENST00000568449 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
EME2-205ENST00000568449 NCAPD3P42695 1498 aa44.44■■■■■ 4.7
EME2-205ENST00000568449 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.44■■■■■ 4.7
EME2-205ENST00000568449 SMARCA2P51531 1590 aa44.34■■■■■ 4.69
EME2-205ENST00000568449 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
EME2-205ENST00000568449 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.15■■■■■ 4.66
EME2-205ENST00000568449 HMGXB3Q12766 1538 aa44.13■■■■■ 4.65
EME2-205ENST00000568449 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
EME2-205ENST00000568449 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
EME2-205ENST00000568449 WIZO95785 1651 aa43.78■■■■■ 4.6
EME2-205ENST00000568449 NESP48681 1621 aa43.36■■■■■ 4.53
EME2-205ENST00000568449 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
EME2-205ENST00000568449 ERCC6Q03468 1493 aa43.24■■■■■ 4.51
EME2-205ENST00000568449 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.2■■■■■ 4.51
EME2-205ENST00000568449 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.17■■■■■ 4.5
EME2-205ENST00000568449 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.01■■■■■ 4.48
EME2-205ENST00000568449 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.9■■■■■ 4.46
EME2-205ENST00000568449 CFTRP13569 1480 aa42.86■■■■■ 4.45
EME2-205ENST00000568449 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
EME2-205ENST00000568449 CUX2O14529 1486 aa42.77■■■■■ 4.44
EME2-205ENST00000568449 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.72■■■■■ 4.43
EME2-205ENST00000568449 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.63■■■■■ 4.42
EME2-205ENST00000568449 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
EME2-205ENST00000568449 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.56■■■■■ 4.4
EME2-205ENST00000568449 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.52■■■■■ 4.4
EME2-205ENST00000568449 WDR62O43379 1518 aa42.34■■■■■ 4.37
EME2-205ENST00000568449 PRDM2Q13029 1718 aa42.3■■■■■ 4.36
EME2-205ENST00000568449 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
EME2-205ENST00000568449 ABCC8Q09428 1581 aa41.95■■■■■ 4.31
EME2-205ENST00000568449 TOPBP1Q92547 1522 aa41.92■■■■■ 4.3
EME2-205ENST00000568449 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.83■■■■■ 4.29
EME2-205ENST00000568449 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.72■■■■■ 4.27
EME2-205ENST00000568449 IFT140Q96RY7 1462 aa41.7■■■■■ 4.27
EME2-205ENST00000568449 CUX1P39880 1505 aa41.57■■■■■ 4.25
EME2-205ENST00000568449 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
EME2-205ENST00000568449 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
EME2-205ENST00000568449 SOGA1O94964 1423 aa41.46■■■■■ 4.23
EME2-205ENST00000568449 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
EME2-205ENST00000568449 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.42■■■■■ 4.22
EME2-205ENST00000568449 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
EME2-205ENST00000568449 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
EME2-205ENST00000568449 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.28e-7■□□□□ 11.3
EME2-205ENST00000568449 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
EME2-205ENST00000568449 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
EME2-205ENST00000568449 TOP2BQ02880 1626 aa41.17■■■■■ 4.18
EME2-205ENST00000568449 SYNJ1O43426 1573 aa41.15■■■■■ 4.18
EME2-205ENST00000568449 OSCARQ8IYS5 282 aa41.14■■■■■ 4.18
EME2-205ENST00000568449 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.11■■■■■ 4.17
EME2-205ENST00000568449 WDR97A6NE52 1622 aa41.07■■■■■ 4.16
EME2-205ENST00000568449 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.05■■■■■ 4.16
EME2-205ENST00000568449 GRIN2BQ13224 1484 aa40.95■■■■■ 4.15
EME2-205ENST00000568449 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.95■■■■■ 4.15
EME2-205ENST00000568449 FBLN2P98095 1184 aa40.91■■■■■ 4.14
EME2-205ENST00000568449 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.87■■■■■ 4.13
EME2-205ENST00000568449 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
EME2-205ENST00000568449 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.81■■■■■ 4.12
EME2-205ENST00000568449 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
EME2-205ENST00000568449 CHD1O14646 1710 aa40.7■■■■■ 4.11
EME2-205ENST00000568449 PBRM1Q86U86 1689 aa40.69■■■■■ 4.1
EME2-205ENST00000568449 SYNJ2O15056 1496 aa40.67■■■■■ 4.1
EME2-205ENST00000568449 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.54■■■■■ 4.08
EME2-205ENST00000568449 KIF27Q86VH2 1401 aa40.5■■■■■ 4.07
EME2-205ENST00000568449 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.48■■■■■ 4.07
EME2-205ENST00000568449 TRIM41Q8WV44 630 aa40.44■■■■■ 4.06
EME2-205ENST00000568449 ADAMTS12P58397 1594 aa40.44■■■■■ 4.06
EME2-205ENST00000568449 GRIN2AQ12879 1464 aa40.39■■■■■ 4.06
EME2-205ENST00000568449 IGF1RP08069 1367 aa40.37■■■■■ 4.05
EME2-205ENST00000568449 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.32■■■■■ 4.05
EME2-205ENST00000568449 ARHGEF11O15085 1522 aa40.32■■■■■ 4.04
EME2-205ENST00000568449 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
EME2-205ENST00000568449 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
EME2-205ENST00000568449 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.27■■■■■ 4.04
EME2-205ENST00000568449 NUP160Q12769 1436 aa40.23■■■■■ 4.03
EME2-205ENST00000568449 CEP170Q5SW79 1584 aa40.14■■■■■ 4.02
EME2-205ENST00000568449 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.13■■■■■ 4.02
EME2-205ENST00000568449 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.1■■■■■ 4.01
EME2-205ENST00000568449 CUL7Q14999 1698 aa40.1■■■■■ 4.01
EME2-205ENST00000568449 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.09■■■■■ 4.01
EME2-205ENST00000568449 ARAP1Q96P48 1450 aa39.99■■■■□ 3.99
EME2-205ENST00000568449 JPH4Q96JJ6 628 aa39.94■■■■□ 3.98
EME2-205ENST00000568449 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.89■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms