RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000632820.1

PGR-AS1-202, PGR antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGR-AS1, Length 1,545 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGR-AS1-202ENST00000632820 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.1■■■■■ 6.25
PGR-AS1-202ENST00000632820 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.32■■■■■ 5.17
PGR-AS1-202ENST00000632820 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
PGR-AS1-202ENST00000632820 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.83■■■■■ 4.77
PGR-AS1-202ENST00000632820 ABCC9O60706 1549 aa44.77■■■■■ 4.76
PGR-AS1-202ENST00000632820 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.48■■■■■ 4.71
PGR-AS1-202ENST00000632820 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.4■■■■■ 4.7
PGR-AS1-202ENST00000632820 NACADO15069 1562 aa44.11■■■■■ 4.65
PGR-AS1-202ENST00000632820 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
PGR-AS1-202ENST00000632820 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.74■■■■■ 4.59
PGR-AS1-202ENST00000632820 SCRIBQ14160 1630 aa43.35■■■■■ 4.53
PGR-AS1-202ENST00000632820 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.79■■■■■ 4.44
PGR-AS1-202ENST00000632820 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.43■■■■■ 4.38
PGR-AS1-202ENST00000632820 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.33
PGR-AS1-202ENST00000632820 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
PGR-AS1-202ENST00000632820 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.99■■■■■ 4.31
PGR-AS1-202ENST00000632820 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PGR-AS1-202ENST00000632820 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
PGR-AS1-202ENST00000632820 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.74■■■■■ 4.27
PGR-AS1-202ENST00000632820 SMARCA4P51532 1647 aa41.62■■■■■ 4.25
PGR-AS1-202ENST00000632820 WIZO95785 1651 aa41.35■■■■■ 4.21
PGR-AS1-202ENST00000632820 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.2■■■■■ 4.19
PGR-AS1-202ENST00000632820 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
PGR-AS1-202ENST00000632820 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PGR-AS1-202ENST00000632820 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.99■■■■■ 4.15
PGR-AS1-202ENST00000632820 SMARCA2P51531 1590 aa40.98■■■■■ 4.15
PGR-AS1-202ENST00000632820 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
PGR-AS1-202ENST00000632820 NCAPD3P42695 1498 aa40.71■■■■■ 4.11
PGR-AS1-202ENST00000632820 HMGXB3Q12766 1538 aa40.65■■■■■ 4.1
PGR-AS1-202ENST00000632820 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.57■■■■■ 4.08
PGR-AS1-202ENST00000632820 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.54■■■■■ 4.08
PGR-AS1-202ENST00000632820 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.21■■■■■ 4.03
PGR-AS1-202ENST00000632820 CFTRP13569 1480 aa39.73■■■■□ 3.95
PGR-AS1-202ENST00000632820 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.65■■■■□ 3.94
PGR-AS1-202ENST00000632820 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.61■■■■□ 3.93
PGR-AS1-202ENST00000632820 TRIM41Q8WV44 630 aa39.58■■■■□ 3.93
PGR-AS1-202ENST00000632820 ABCC8Q09428 1581 aa39.55■■■■□ 3.92
PGR-AS1-202ENST00000632820 PRDM2Q13029 1718 aa39.5■■■■□ 3.91
PGR-AS1-202ENST00000632820 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.39■■■■□ 3.9
PGR-AS1-202ENST00000632820 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.34■■■■□ 3.89
PGR-AS1-202ENST00000632820 NESP48681 1621 aa39.25■■■■□ 3.87
PGR-AS1-202ENST00000632820 SYNJ1O43426 1573 aa39.24■■■■□ 3.87
PGR-AS1-202ENST00000632820 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.15■■■■□ 3.86
PGR-AS1-202ENST00000632820 TOP2BQ02880 1626 aa39.13■■■■□ 3.85
PGR-AS1-202ENST00000632820 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.1■■■■□ 3.85
PGR-AS1-202ENST00000632820 CUX1P39880 1505 aa39.05■■■■□ 3.84
PGR-AS1-202ENST00000632820 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.02■■■■□ 3.84
PGR-AS1-202ENST00000632820 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.92■■■■□ 3.82
PGR-AS1-202ENST00000632820 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.8■■■■□ 3.8
PGR-AS1-202ENST00000632820 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.8■■■■□ 3.8
PGR-AS1-202ENST00000632820 SOGA1O94964 1423 aa38.79■■■■□ 3.8
PGR-AS1-202ENST00000632820 EEA1Q15075 1411 aa38.78■■■■□ 3.8
PGR-AS1-202ENST00000632820 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
PGR-AS1-202ENST00000632820 TOPBP1Q92547 1522 aa38.72■■■■□ 3.79
PGR-AS1-202ENST00000632820 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
PGR-AS1-202ENST00000632820 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.64■■■■□ 3.78
PGR-AS1-202ENST00000632820 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.64■■■■□ 3.78
PGR-AS1-202ENST00000632820 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.56■■■■□ 3.76
PGR-AS1-202ENST00000632820 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.54■■■■□ 3.76
PGR-AS1-202ENST00000632820 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
PGR-AS1-202ENST00000632820 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.49■■■■□ 3.75
PGR-AS1-202ENST00000632820 KIF27Q86VH2 1401 aa38.42■■■■□ 3.74
PGR-AS1-202ENST00000632820 ERCC6Q03468 1493 aa38.42■■■■□ 3.74
PGR-AS1-202ENST00000632820 WDR62O43379 1518 aa38.37■■■■□ 3.73
PGR-AS1-202ENST00000632820 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.35■■■■□ 3.73
PGR-AS1-202ENST00000632820 CUX2O14529 1486 aa38.34■■■■□ 3.73
PGR-AS1-202ENST00000632820 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.33■■■■□ 3.73
PGR-AS1-202ENST00000632820 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
PGR-AS1-202ENST00000632820 KIF21BO75037 1637 aa38.27■■■■□ 3.72
PGR-AS1-202ENST00000632820 WDR97A6NE52 1622 aa38.24■■■■□ 3.71
PGR-AS1-202ENST00000632820 GOLGA3Q08378 1498 aa38.18■■■■□ 3.7
PGR-AS1-202ENST00000632820 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
PGR-AS1-202ENST00000632820 PRXQ9BXM0 1461 aa38.15■■■■□ 3.7
PGR-AS1-202ENST00000632820 IGF1RP08069 1367 aa38.11■■■■□ 3.69
PGR-AS1-202ENST00000632820 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.1■■■■□ 3.69
PGR-AS1-202ENST00000632820 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.07■■■■□ 3.68
PGR-AS1-202ENST00000632820 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.05■■■■□ 3.68
PGR-AS1-202ENST00000632820 IFT140Q96RY7 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
PGR-AS1-202ENST00000632820 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.03■■■■□ 3.68
PGR-AS1-202ENST00000632820 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.03■■■■□ 3.68
PGR-AS1-202ENST00000632820 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
PGR-AS1-202ENST00000632820 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.94■■■■□ 3.66
PGR-AS1-202ENST00000632820 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
PGR-AS1-202ENST00000632820 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.89■■■■□ 3.66
PGR-AS1-202ENST00000632820 CUL7Q14999 1698 aa37.86■■■■□ 3.65
PGR-AS1-202ENST00000632820 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
PGR-AS1-202ENST00000632820 CEP162Q5TB80 1403 aa37.78■■■■□ 3.64
PGR-AS1-202ENST00000632820 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.76■■■■□ 3.64
PGR-AS1-202ENST00000632820 PBRM1Q86U86 1689 aa37.73■■■■□ 3.63
PGR-AS1-202ENST00000632820 GRIN2BQ13224 1484 aa37.7■■■■□ 3.63
PGR-AS1-202ENST00000632820 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
PGR-AS1-202ENST00000632820 ADAMTS12P58397 1594 aa37.57■■■■□ 3.6
PGR-AS1-202ENST00000632820 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.56■■■■□ 3.6
PGR-AS1-202ENST00000632820 CLIP1P30622 1438 aa37.54■■■■□ 3.6
PGR-AS1-202ENST00000632820 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.44■■■■□ 3.58
PGR-AS1-202ENST00000632820 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
PGR-AS1-202ENST00000632820 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.36■■■■□ 3.57
PGR-AS1-202ENST00000632820 SYNJ2O15056 1496 aa37.28■■■■□ 3.56
PGR-AS1-202ENST00000632820 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.25■■■■□ 3.55
PGR-AS1-202ENST00000632820 GRIN2AQ12879 1464 aa37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms