RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.35■■■■■ 6.93
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.93■■■■■ 5.9
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC9O60706 1549 aa51.33■■■■■ 5.81
VSTM2A-202ENST00000402613 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.14■■■■■ 5.46
VSTM2A-202ENST00000402613 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.02■■■■■ 5.44
VSTM2A-202ENST00000402613 NACADO15069 1562 aa49.01■■■■■ 5.44
VSTM2A-202ENST00000402613 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.59■■■■■ 5.37
VSTM2A-202ENST00000402613 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.35
VSTM2A-202ENST00000402613 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.23■■■■■ 5.31
VSTM2A-202ENST00000402613 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.98■■■■■ 5.27
VSTM2A-202ENST00000402613 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.91■■■■■ 5.26
VSTM2A-202ENST00000402613 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.69■■■■■ 5.22
VSTM2A-202ENST00000402613 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.58■■■■■ 5.21
VSTM2A-202ENST00000402613 SCRIBQ14160 1630 aa47.41■■■■■ 5.18
VSTM2A-202ENST00000402613 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.13■■■■■ 5.13
VSTM2A-202ENST00000402613 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
VSTM2A-202ENST00000402613 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.36■■■■■ 5.01
VSTM2A-202ENST00000402613 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.17■■■■■ 4.98
VSTM2A-202ENST00000402613 SMARCA4P51532 1647 aa45.31■■■■■ 4.84
VSTM2A-202ENST00000402613 NCAPD3P42695 1498 aa45.29■■■■■ 4.84
VSTM2A-202ENST00000402613 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.23■■■■■ 4.83
VSTM2A-202ENST00000402613 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
VSTM2A-202ENST00000402613 SMARCA2P51531 1590 aa45.11■■■■■ 4.81
VSTM2A-202ENST00000402613 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.97■■■■■ 4.79
VSTM2A-202ENST00000402613 HMGXB3Q12766 1538 aa44.95■■■■■ 4.79
VSTM2A-202ENST00000402613 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.89■■■■■ 4.78
VSTM2A-202ENST00000402613 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
VSTM2A-202ENST00000402613 WIZO95785 1651 aa44.42■■■■■ 4.7
VSTM2A-202ENST00000402613 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
VSTM2A-202ENST00000402613 NESP48681 1621 aa44.3■■■■■ 4.68
VSTM2A-202ENST00000402613 ERCC6Q03468 1493 aa44.26■■■■■ 4.68
VSTM2A-202ENST00000402613 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.08■■■■■ 4.65
VSTM2A-202ENST00000402613 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.96■■■■■ 4.63
VSTM2A-202ENST00000402613 CUX2O14529 1486 aa43.93■■■■■ 4.62
VSTM2A-202ENST00000402613 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
VSTM2A-202ENST00000402613 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.86■■■■■ 4.61
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.65■■■■■ 4.58
VSTM2A-202ENST00000402613 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
VSTM2A-202ENST00000402613 CFTRP13569 1480 aa43.59■■■■■ 4.57
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.48■■■■■ 4.55
VSTM2A-202ENST00000402613 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.42■■■■■ 4.54
VSTM2A-202ENST00000402613 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.4■■■■■ 4.54
VSTM2A-202ENST00000402613 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.38■■■■■ 4.53
VSTM2A-202ENST00000402613 WDR62O43379 1518 aa43.26■■■■■ 4.52
VSTM2A-202ENST00000402613 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.14■■■■■ 4.5
VSTM2A-202ENST00000402613 PRDM2Q13029 1718 aa43.02■■■■■ 4.48
VSTM2A-202ENST00000402613 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
VSTM2A-202ENST00000402613 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
VSTM2A-202ENST00000402613 TOPBP1Q92547 1522 aa42.67■■■■■ 4.42
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCC8Q09428 1581 aa42.64■■■■■ 4.42
VSTM2A-202ENST00000402613 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.55■■■■■ 4.4
VSTM2A-202ENST00000402613 IFT140Q96RY7 1462 aa42.5■■■■■ 4.39
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
VSTM2A-202ENST00000402613 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
VSTM2A-202ENST00000402613 CUX1P39880 1505 aa42.2■■■■■ 4.35
VSTM2A-202ENST00000402613 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
VSTM2A-202ENST00000402613 SOGA1O94964 1423 aa42.15■■■■■ 4.34
VSTM2A-202ENST00000402613 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.14■■■■■ 4.34
VSTM2A-202ENST00000402613 OSCARQ8IYS5 282 aa42.13■■■■■ 4.33
VSTM2A-202ENST00000402613 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.12■■■■■ 4.33
VSTM2A-202ENST00000402613 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
VSTM2A-202ENST00000402613 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
VSTM2A-202ENST00000402613 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
VSTM2A-202ENST00000402613 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.81■■■■■ 4.28
VSTM2A-202ENST00000402613 WDR97A6NE52 1622 aa41.8■■■■■ 4.28
VSTM2A-202ENST00000402613 FBLN2P98095 1184 aa41.7■■■■■ 4.27
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.27
VSTM2A-202ENST00000402613 TOP2BQ02880 1626 aa41.69■■■■■ 4.27
VSTM2A-202ENST00000402613 SYNJ1O43426 1573 aa41.67■■■■■ 4.26
VSTM2A-202ENST00000402613 GRIN2BQ13224 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
VSTM2A-202ENST00000402613 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.66■■■■■ 4.26
VSTM2A-202ENST00000402613 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.66■■■■■ 4.26
VSTM2A-202ENST00000402613 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.63■■■■■ 4.25
VSTM2A-202ENST00000402613 CHD1O14646 1710 aa41.59■■■■■ 4.25
VSTM2A-202ENST00000402613 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
VSTM2A-202ENST00000402613 TRIM41Q8WV44 630 aa41.54■■■■■ 4.24
VSTM2A-202ENST00000402613 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
VSTM2A-202ENST00000402613 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.51■■■■■ 4.23
VSTM2A-202ENST00000402613 SYNJ2O15056 1496 aa41.44■■■■■ 4.22
VSTM2A-202ENST00000402613 PBRM1Q86U86 1689 aa41.42■■■■■ 4.22
VSTM2A-202ENST00000402613 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
VSTM2A-202ENST00000402613 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
VSTM2A-202ENST00000402613 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
VSTM2A-202ENST00000402613 ARHGEF11O15085 1522 aa41.35■■■■■ 4.21
VSTM2A-202ENST00000402613 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.22■■■■■ 4.19
VSTM2A-202ENST00000402613 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.18■■■■■ 4.18
VSTM2A-202ENST00000402613 ADAMTS12P58397 1594 aa41.15■■■■■ 4.18
VSTM2A-202ENST00000402613 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.14■■■■■ 4.18
VSTM2A-202ENST00000402613 GRIN2AQ12879 1464 aa41.12■■■■■ 4.17
VSTM2A-202ENST00000402613 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.09■■■■■ 4.17
VSTM2A-202ENST00000402613 ARAP1Q96P48 1450 aa41.02■■■■■ 4.16
VSTM2A-202ENST00000402613 NUP160Q12769 1436 aa40.98■■■■■ 4.15
VSTM2A-202ENST00000402613 KIF27Q86VH2 1401 aa40.97■■■■■ 4.15
VSTM2A-202ENST00000402613 CEP170Q5SW79 1584 aa40.91■■■■■ 4.14
VSTM2A-202ENST00000402613 IGF1RP08069 1367 aa40.9■■■■■ 4.14
VSTM2A-202ENST00000402613 CUL7Q14999 1698 aa40.66■■■■■ 4.1
VSTM2A-202ENST00000402613 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.64■■■■■ 4.1
VSTM2A-202ENST00000402613 SHROOM2Q13796 1616 aa40.64■■■■■ 4.1
VSTM2A-202ENST00000402613 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.63■■■■■ 4.1
VSTM2A-202ENST00000402613 JPH4Q96JJ6 628 aa40.62■■■■■ 4.09
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