Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD12P35452 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXD12P35452 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD12P35452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXD12P35452 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms