RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.09■■■■■ 6.57
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.22■■■■■ 5.63
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC9O60706 1549 aa50.21■■■■■ 5.63
POLR2F-211ENST00000488684 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.78■■■■■ 5.24
POLR2F-211ENST00000488684 NACADO15069 1562 aa47.49■■■■■ 5.19
POLR2F-211ENST00000488684 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.35■■■■■ 5.17
POLR2F-211ENST00000488684 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.13■■■■■ 5.14
POLR2F-211ENST00000488684 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.86■■■■■ 5.09
POLR2F-211ENST00000488684 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.82■■■■■ 5.09
POLR2F-211ENST00000488684 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.74■■■■■ 5.07
POLR2F-211ENST00000488684 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
POLR2F-211ENST00000488684 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.46■■■■■ 5.03
POLR2F-211ENST00000488684 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.31■■■■■ 5
POLR2F-211ENST00000488684 SCRIBQ14160 1630 aa45.81■■■■■ 4.92
POLR2F-211ENST00000488684 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.74■■■■■ 4.91
POLR2F-211ENST00000488684 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.35■■■■■ 4.85
POLR2F-211ENST00000488684 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
POLR2F-211ENST00000488684 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.21■■■■■ 4.83
POLR2F-211ENST00000488684 NCAPD3P42695 1498 aa43.89■■■■■ 4.62
POLR2F-211ENST00000488684 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.76■■■■■ 4.6
POLR2F-211ENST00000488684 SMARCA4P51532 1647 aa43.72■■■■■ 4.59
POLR2F-211ENST00000488684 SMARCA2P51531 1590 aa43.59■■■■■ 4.57
POLR2F-211ENST00000488684 HMGXB3Q12766 1538 aa43.52■■■■■ 4.56
POLR2F-211ENST00000488684 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
POLR2F-211ENST00000488684 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
POLR2F-211ENST00000488684 ERCC6Q03468 1493 aa43.3■■■■■ 4.52
POLR2F-211ENST00000488684 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.29■■■■■ 4.52
POLR2F-211ENST00000488684 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.25■■■■■ 4.51
POLR2F-211ENST00000488684 NESP48681 1621 aa43.19■■■■■ 4.51
POLR2F-211ENST00000488684 CUX2O14529 1486 aa43.19■■■■■ 4.5
POLR2F-211ENST00000488684 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.14■■■■■ 4.5
POLR2F-211ENST00000488684 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.83■■■■■ 4.45
POLR2F-211ENST00000488684 WIZO95785 1651 aa42.73■■■■■ 4.43
POLR2F-211ENST00000488684 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
POLR2F-211ENST00000488684 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.59■■■■■ 4.41
POLR2F-211ENST00000488684 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.59■■■■■ 4.41
POLR2F-211ENST00000488684 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.55■■■■■ 4.4
POLR2F-211ENST00000488684 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
POLR2F-211ENST00000488684 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.22■■■■■ 4.35
POLR2F-211ENST00000488684 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
POLR2F-211ENST00000488684 WDR62O43379 1518 aa42.11■■■■■ 4.33
POLR2F-211ENST00000488684 CFTRP13569 1480 aa42.09■■■■■ 4.33
POLR2F-211ENST00000488684 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.06■■■■■ 4.32
POLR2F-211ENST00000488684 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.05■■■■■ 4.32
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.73■■■■■ 4.27
POLR2F-211ENST00000488684 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
POLR2F-211ENST00000488684 PRDM2Q13029 1718 aa41.6■■■■■ 4.25
POLR2F-211ENST00000488684 OSCARQ8IYS5 282 aa41.29■■■■■ 4.2
POLR2F-211ENST00000488684 TOPBP1Q92547 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM41Q8WV44 630 aa41.27■■■■■ 4.2
POLR2F-211ENST00000488684 IFT140Q96RY7 1462 aa41.23■■■■■ 4.19
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
POLR2F-211ENST00000488684 ABCC8Q09428 1581 aa41.15■■■■■ 4.18
POLR2F-211ENST00000488684 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.11■■■■■ 4.17
POLR2F-211ENST00000488684 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
POLR2F-211ENST00000488684 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
POLR2F-211ENST00000488684 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.131e-6■■■■■ 34.6
POLR2F-211ENST00000488684 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
POLR2F-211ENST00000488684 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.75■■■■■ 4.11
POLR2F-211ENST00000488684 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.71■■■■■ 4.11
POLR2F-211ENST00000488684 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.71■■■■■ 4.11
POLR2F-211ENST00000488684 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.71■■■■■ 4.11
POLR2F-211ENST00000488684 SOGA1O94964 1423 aa40.69■■■■■ 4.1
POLR2F-211ENST00000488684 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
POLR2F-211ENST00000488684 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
POLR2F-211ENST00000488684 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.62■■■■■ 4.09
POLR2F-211ENST00000488684 CUX1P39880 1505 aa40.62■■■■■ 4.09
POLR2F-211ENST00000488684 CHD1O14646 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF11O15085 1522 aa40.6■■■■■ 4.09
POLR2F-211ENST00000488684 FBLN2P98095 1184 aa40.56■■■■■ 4.08
POLR2F-211ENST00000488684 WDR97A6NE52 1622 aa40.42■■■■■ 4.06
POLR2F-211ENST00000488684 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.39■■■■■ 4.06
POLR2F-211ENST00000488684 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.34■■■■■ 4.05
POLR2F-211ENST00000488684 GRIN2BQ13224 1484 aa40.3■■■■■ 4.04
POLR2F-211ENST00000488684 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
POLR2F-211ENST00000488684 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
POLR2F-211ENST00000488684 ARAP1Q96P48 1450 aa40.22■■■■■ 4.03
POLR2F-211ENST00000488684 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.19■■■■■ 4.02
POLR2F-211ENST00000488684 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.16■■■■■ 4.02
POLR2F-211ENST00000488684 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.16■■■■■ 4.02
POLR2F-211ENST00000488684 SYNJ2O15056 1496 aa40.15■■■■■ 4.02
POLR2F-211ENST00000488684 PBRM1Q86U86 1689 aa40.12■■■■■ 4.01
POLR2F-211ENST00000488684 SYNJ1O43426 1573 aa40.1■■■■■ 4.01
POLR2F-211ENST00000488684 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
POLR2F-211ENST00000488684 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.01■■■■■ 4
POLR2F-211ENST00000488684 TOP2BQ02880 1626 aa39.96■■■■□ 3.99
POLR2F-211ENST00000488684 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.95■■■■□ 3.99
POLR2F-211ENST00000488684 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
POLR2F-211ENST00000488684 GRIN2AQ12879 1464 aa39.79■■■■□ 3.96
POLR2F-211ENST00000488684 ADAMTS12P58397 1594 aa39.76■■■■□ 3.95
POLR2F-211ENST00000488684 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.67■■■■□ 3.94
POLR2F-211ENST00000488684 NUP160Q12769 1436 aa39.65■■■■□ 3.94
POLR2F-211ENST00000488684 CEP170Q5SW79 1584 aa39.65■■■■□ 3.94
POLR2F-211ENST00000488684 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
POLR2F-211ENST00000488684 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.59■■■■□ 3.93
POLR2F-211ENST00000488684 SHROOM2Q13796 1616 aa39.46■■■■□ 3.91
POLR2F-211ENST00000488684 JPH4Q96JJ6 628 aa39.3■■■■□ 3.88
POLR2F-211ENST00000488684 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
POLR2F-211ENST00000488684 IGF1RP08069 1367 aa39.23■■■■□ 3.87
POLR2F-211ENST00000488684 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.19■■■■□ 3.86
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