RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272898.11

SPAG16-201, Transcript of sperm associated antigen 16, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPAG16, Length 1,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG16-201ENST00000272898 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.61■■■■■ 6.49
SPAG16-201ENST00000272898 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.62■■■■■ 5.53
SPAG16-201ENST00000272898 ABCC9O60706 1549 aa48.86■■■■■ 5.41
SPAG16-201ENST00000272898 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.89■■■■■ 5.1
SPAG16-201ENST00000272898 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.76■■■■■ 5.08
SPAG16-201ENST00000272898 NACADO15069 1562 aa46.71■■■■■ 5.07
SPAG16-201ENST00000272898 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
SPAG16-201ENST00000272898 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.25■■■■■ 4.99
SPAG16-201ENST00000272898 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.97■■■■■ 4.95
SPAG16-201ENST00000272898 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.72■■■■■ 4.91
SPAG16-201ENST00000272898 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.58■■■■■ 4.89
SPAG16-201ENST00000272898 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.33■■■■■ 4.85
SPAG16-201ENST00000272898 SCRIBQ14160 1630 aa45.32■■■■■ 4.85
SPAG16-201ENST00000272898 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.92■■■■■ 4.78
SPAG16-201ENST00000272898 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.9■■■■■ 4.78
SPAG16-201ENST00000272898 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
SPAG16-201ENST00000272898 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.14■■■■■ 4.66
SPAG16-201ENST00000272898 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.92■■■■■ 4.62
SPAG16-201ENST00000272898 SMARCA4P51532 1647 aa43.25■■■■■ 4.51
SPAG16-201ENST00000272898 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
SPAG16-201ENST00000272898 SMARCA2P51531 1590 aa43.07■■■■■ 4.48
SPAG16-201ENST00000272898 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.05■■■■■ 4.48
SPAG16-201ENST00000272898 NCAPD3P42695 1498 aa43.03■■■■■ 4.48
SPAG16-201ENST00000272898 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
SPAG16-201ENST00000272898 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.84■■■■■ 4.45
SPAG16-201ENST00000272898 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
SPAG16-201ENST00000272898 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.75■■■■■ 4.43
SPAG16-201ENST00000272898 WIZO95785 1651 aa42.41■■■■■ 4.38
SPAG16-201ENST00000272898 ERCC6Q03468 1493 aa42.24■■■■■ 4.35
SPAG16-201ENST00000272898 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
SPAG16-201ENST00000272898 NESP48681 1621 aa42.13■■■■■ 4.34
SPAG16-201ENST00000272898 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.04■■■■■ 4.32
SPAG16-201ENST00000272898 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SPAG16-201ENST00000272898 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.81■■■■■ 4.28
SPAG16-201ENST00000272898 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.79■■■■■ 4.28
SPAG16-201ENST00000272898 CUX2O14529 1486 aa41.79■■■■■ 4.28
SPAG16-201ENST00000272898 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.68■■■■■ 4.26
SPAG16-201ENST00000272898 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
SPAG16-201ENST00000272898 CFTRP13569 1480 aa41.48■■■■■ 4.23
SPAG16-201ENST00000272898 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.42■■■■■ 4.22
SPAG16-201ENST00000272898 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.41■■■■■ 4.22
SPAG16-201ENST00000272898 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.39■■■■■ 4.22
SPAG16-201ENST00000272898 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.37■■■■■ 4.21
SPAG16-201ENST00000272898 PRDM2Q13029 1718 aa41.23■■■■■ 4.19
SPAG16-201ENST00000272898 WDR62O43379 1518 aa41.19■■■■■ 4.18
SPAG16-201ENST00000272898 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
SPAG16-201ENST00000272898 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SPAG16-201ENST00000272898 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.74■■■■■ 4.11
SPAG16-201ENST00000272898 ABCC8Q09428 1581 aa40.68■■■■■ 4.1
SPAG16-201ENST00000272898 TOPBP1Q92547 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
SPAG16-201ENST00000272898 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.62■■■■■ 4.09
SPAG16-201ENST00000272898 IFT140Q96RY7 1462 aa40.51■■■■■ 4.08
SPAG16-201ENST00000272898 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
SPAG16-201ENST00000272898 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
SPAG16-201ENST00000272898 CUX1P39880 1505 aa40.23■■■■■ 4.03
SPAG16-201ENST00000272898 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
SPAG16-201ENST00000272898 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
SPAG16-201ENST00000272898 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.19■■■■■ 4.02
SPAG16-201ENST00000272898 SOGA1O94964 1423 aa40.15■■■■■ 4.02
SPAG16-201ENST00000272898 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.13■■■■■ 4.01
SPAG16-201ENST00000272898 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 41e-8■■■□□ 15.8
SPAG16-201ENST00000272898 OSCARQ8IYS5 282 aa40■■■■□ 3.99
SPAG16-201ENST00000272898 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
SPAG16-201ENST00000272898 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
SPAG16-201ENST00000272898 WDR97A6NE52 1622 aa39.93■■■■□ 3.98
SPAG16-201ENST00000272898 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
SPAG16-201ENST00000272898 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.83■■■■□ 3.97
SPAG16-201ENST00000272898 SYNJ1O43426 1573 aa39.8■■■■□ 3.96
SPAG16-201ENST00000272898 FBLN2P98095 1184 aa39.78■■■■□ 3.96
SPAG16-201ENST00000272898 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.75■■■■□ 3.95
SPAG16-201ENST00000272898 CHD1O14646 1710 aa39.74■■■■□ 3.95
SPAG16-201ENST00000272898 GRIN2BQ13224 1484 aa39.74■■■■□ 3.95
SPAG16-201ENST00000272898 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.73■■■■□ 3.95
SPAG16-201ENST00000272898 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.69■■■■□ 3.94
SPAG16-201ENST00000272898 PBRM1Q86U86 1689 aa39.66■■■■□ 3.94
SPAG16-201ENST00000272898 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
SPAG16-201ENST00000272898 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.62■■■■□ 3.93
SPAG16-201ENST00000272898 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
SPAG16-201ENST00000272898 SYNJ2O15056 1496 aa39.49■■■■□ 3.91
SPAG16-201ENST00000272898 TRIM41Q8WV44 630 aa39.48■■■■□ 3.91
SPAG16-201ENST00000272898 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
SPAG16-201ENST00000272898 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
SPAG16-201ENST00000272898 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.39■■■■□ 3.9
SPAG16-201ENST00000272898 ARHGEF11O15085 1522 aa39.35■■■■□ 3.89
SPAG16-201ENST00000272898 ADAMTS12P58397 1594 aa39.3■■■■□ 3.88
SPAG16-201ENST00000272898 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.3■■■■□ 3.88
SPAG16-201ENST00000272898 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.24■■■■□ 3.87
SPAG16-201ENST00000272898 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.22■■■■□ 3.87
SPAG16-201ENST00000272898 GRIN2AQ12879 1464 aa39.21■■■■□ 3.87
SPAG16-201ENST00000272898 KIF27Q86VH2 1401 aa39.14■■■■□ 3.86
SPAG16-201ENST00000272898 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.03■■■■□ 3.84
SPAG16-201ENST00000272898 CEP170Q5SW79 1584 aa39■■■■□ 3.83
SPAG16-201ENST00000272898 ARAP1Q96P48 1450 aa38.99■■■■□ 3.83
SPAG16-201ENST00000272898 NUP160Q12769 1436 aa38.98■■■■□ 3.83
SPAG16-201ENST00000272898 CUL7Q14999 1698 aa38.94■■■■□ 3.82
SPAG16-201ENST00000272898 IGF1RP08069 1367 aa38.89■■■■□ 3.82
SPAG16-201ENST00000272898 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.74■■■■□ 3.79
SPAG16-201ENST00000272898 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.73■■■■□ 3.79
SPAG16-201ENST00000272898 SHROOM2Q13796 1616 aa38.72■■■■□ 3.79
SPAG16-201ENST00000272898 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms