RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219535.7

FAM173A-201, Transcript of family with sequence similarity 173 member A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene FAM173A, Length 806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM173A-201ENST00000219535 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.43■■■■■ 6.62
FAM173A-201ENST00000219535 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.44■■■■■ 5.67
FAM173A-201ENST00000219535 ABCC9O60706 1549 aa50.15■■■■■ 5.62
FAM173A-201ENST00000219535 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.81■■■■■ 5.24
FAM173A-201ENST00000219535 NACADO15069 1562 aa47.55■■■■■ 5.2
FAM173A-201ENST00000219535 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.5■■■■■ 5.19
FAM173A-201ENST00000219535 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
FAM173A-201ENST00000219535 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.91■■■■■ 5.1
FAM173A-201ENST00000219535 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
FAM173A-201ENST00000219535 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.77■■■■■ 5.08
FAM173A-201ENST00000219535 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.72■■■■■ 5.07
FAM173A-201ENST00000219535 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.55■■■■■ 5.04
FAM173A-201ENST00000219535 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.51■■■■■ 5.04
FAM173A-201ENST00000219535 SCRIBQ14160 1630 aa46.11■■■■■ 4.97
FAM173A-201ENST00000219535 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.71■■■■■ 4.91
FAM173A-201ENST00000219535 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.3■■■■■ 4.84
FAM173A-201ENST00000219535 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
FAM173A-201ENST00000219535 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.07■■■■■ 4.81
FAM173A-201ENST00000219535 SMARCA4P51532 1647 aa43.98■■■■■ 4.63
FAM173A-201ENST00000219535 NCAPD3P42695 1498 aa43.89■■■■■ 4.62
FAM173A-201ENST00000219535 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.88■■■■■ 4.61
FAM173A-201ENST00000219535 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
FAM173A-201ENST00000219535 SMARCA2P51531 1590 aa43.73■■■■■ 4.59
FAM173A-201ENST00000219535 HMGXB3Q12766 1538 aa43.63■■■■■ 4.57
FAM173A-201ENST00000219535 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.55■■■■■ 4.56
FAM173A-201ENST00000219535 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.47■■■■■ 4.55
FAM173A-201ENST00000219535 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
FAM173A-201ENST00000219535 NESP48681 1621 aa43.24■■■■■ 4.51
FAM173A-201ENST00000219535 ERCC6Q03468 1493 aa43.2■■■■■ 4.51
FAM173A-201ENST00000219535 WIZO95785 1651 aa43.09■■■■■ 4.49
FAM173A-201ENST00000219535 CUX2O14529 1486 aa42.93■■■■■ 4.46
FAM173A-201ENST00000219535 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.86■■■■■ 4.45
FAM173A-201ENST00000219535 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
FAM173A-201ENST00000219535 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.7■■■■■ 4.43
FAM173A-201ENST00000219535 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
FAM173A-201ENST00000219535 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.6■■■■■ 4.41
FAM173A-201ENST00000219535 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.56■■■■■ 4.4
FAM173A-201ENST00000219535 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
FAM173A-201ENST00000219535 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.47■■■■■ 4.39
FAM173A-201ENST00000219535 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.23■■■■■ 4.35
FAM173A-201ENST00000219535 CFTRP13569 1480 aa42.21■■■■■ 4.35
FAM173A-201ENST00000219535 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.16■■■■■ 4.34
FAM173A-201ENST00000219535 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.15■■■■■ 4.34
FAM173A-201ENST00000219535 WDR62O43379 1518 aa42.13■■■■■ 4.33
FAM173A-201ENST00000219535 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.02■■■■■ 4.32
FAM173A-201ENST00000219535 PRDM2Q13029 1718 aa41.89■■■■■ 4.3
FAM173A-201ENST00000219535 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
FAM173A-201ENST00000219535 TOPBP1Q92547 1522 aa41.42■■■■■ 4.22
FAM173A-201ENST00000219535 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.29■■■■■ 4.2
FAM173A-201ENST00000219535 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
FAM173A-201ENST00000219535 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
FAM173A-201ENST00000219535 ABCC8Q09428 1581 aa41.22■■■■■ 4.19
FAM173A-201ENST00000219535 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
FAM173A-201ENST00000219535 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
FAM173A-201ENST00000219535 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
FAM173A-201ENST00000219535 OSCARQ8IYS5 282 aa41.04■■■■■ 4.16
FAM173A-201ENST00000219535 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
FAM173A-201ENST00000219535 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.92■■■■■ 4.14
FAM173A-201ENST00000219535 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.92■■■■■ 4.14
FAM173A-201ENST00000219535 CUX1P39880 1505 aa40.89■■■■■ 4.14
FAM173A-201ENST00000219535 TRIM41Q8WV44 630 aa40.87■■■■■ 4.13
FAM173A-201ENST00000219535 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.84■■■■■ 4.13
FAM173A-201ENST00000219535 SOGA1O94964 1423 aa40.81■■■■■ 4.12
FAM173A-201ENST00000219535 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
FAM173A-201ENST00000219535 CHD1O14646 1710 aa40.72■■■■■ 4.11
FAM173A-201ENST00000219535 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.59■■■■■ 4.09
FAM173A-201ENST00000219535 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.59■■■■■ 4.09
FAM173A-201ENST00000219535 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.59■■■■■ 4.09
FAM173A-201ENST00000219535 WDR97A6NE52 1622 aa40.56■■■■■ 4.08
FAM173A-201ENST00000219535 FBLN2P98095 1184 aa40.55■■■■■ 4.08
FAM173A-201ENST00000219535 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.51■■■■■ 4.08
FAM173A-201ENST00000219535 ARHGEF11O15085 1522 aa40.46■■■■■ 4.07
FAM173A-201ENST00000219535 GRIN2BQ13224 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
FAM173A-201ENST00000219535 PBRM1Q86U86 1689 aa40.37■■■■■ 4.05
FAM173A-201ENST00000219535 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.35■■■■■ 4.05
FAM173A-201ENST00000219535 SYNJ1O43426 1573 aa40.35■■■■■ 4.05
FAM173A-201ENST00000219535 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
FAM173A-201ENST00000219535 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.33■■■■■ 4.05
FAM173A-201ENST00000219535 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.32■■■■■ 4.05
FAM173A-201ENST00000219535 TOP2BQ02880 1626 aa40.31■■■■■ 4.04
FAM173A-201ENST00000219535 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.31■■■■■ 4.04
FAM173A-201ENST00000219535 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
FAM173A-201ENST00000219535 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
FAM173A-201ENST00000219535 SYNJ2O15056 1496 aa40.22■■■■■ 4.03
FAM173A-201ENST00000219535 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.18■■■■■ 4.02
FAM173A-201ENST00000219535 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.12■■■■■ 4.01
FAM173A-201ENST00000219535 ARAP1Q96P48 1450 aa40.12■■■■■ 4.01
FAM173A-201ENST00000219535 ADAMTS12P58397 1594 aa39.98■■■■□ 3.99
FAM173A-201ENST00000219535 GRIN2AQ12879 1464 aa39.91■■■■□ 3.98
FAM173A-201ENST00000219535 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.83■■■■□ 3.97
FAM173A-201ENST00000219535 CEP170Q5SW79 1584 aa39.81■■■■□ 3.96
FAM173A-201ENST00000219535 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.81■■■■□ 3.96
FAM173A-201ENST00000219535 NUP160Q12769 1436 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM173A-201ENST00000219535 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.69■■■■□ 3.94
FAM173A-201ENST00000219535 SHROOM2Q13796 1616 aa39.55■■■■□ 3.92
FAM173A-201ENST00000219535 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
FAM173A-201ENST00000219535 KIF27Q86VH2 1401 aa39.47■■■■□ 3.91
FAM173A-201ENST00000219535 IGF1RP08069 1367 aa39.45■■■■□ 3.91
FAM173A-201ENST00000219535 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.4■■■■□ 3.9
FAM173A-201ENST00000219535 CUL7Q14999 1698 aa39.36■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms