RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216367.9

POLE2-201, Transcript of DNA polymerase epsilon 2, accessory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene POLE2, Length 1,776 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2-201ENST00000216367 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.27■■■■■ 6.6
POLE2-201ENST00000216367 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.79■■■■■ 5.56
POLE2-201ENST00000216367 ABCC9O60706 1549 aa48■■■■■ 5.27
POLE2-201ENST00000216367 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
POLE2-201ENST00000216367 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.65■■■■■ 5.06
POLE2-201ENST00000216367 NACADO15069 1562 aa46.65■■■■■ 5.06
POLE2-201ENST00000216367 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.65■■■■■ 5.06
POLE2-201ENST00000216367 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.52■■■■■ 5.04
POLE2-201ENST00000216367 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.51■■■■■ 5.04
POLE2-201ENST00000216367 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.51■■■■■ 4.88
POLE2-201ENST00000216367 SCRIBQ14160 1630 aa45.38■■■■■ 4.85
POLE2-201ENST00000216367 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.15■■■■■ 4.82
POLE2-201ENST00000216367 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.92■■■■■ 4.78
POLE2-201ENST00000216367 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.76■■■■■ 4.76
POLE2-201ENST00000216367 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
POLE2-201ENST00000216367 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.73■■■■■ 4.59
POLE2-201ENST00000216367 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
POLE2-201ENST00000216367 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.55■■■■■ 4.56
POLE2-201ENST00000216367 SMARCA4P51532 1647 aa43.53■■■■■ 4.56
POLE2-201ENST00000216367 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.52■■■■■ 4.56
POLE2-201ENST00000216367 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.36■■■■■ 4.53
POLE2-201ENST00000216367 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.16■■■■■ 4.5
POLE2-201ENST00000216367 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.13■■■■■ 4.5
POLE2-201ENST00000216367 SMARCA2P51531 1590 aa43.11■■■■■ 4.49
POLE2-201ENST00000216367 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
POLE2-201ENST00000216367 NCAPD3P42695 1498 aa43.04■■■■■ 4.48
POLE2-201ENST00000216367 WIZO95785 1651 aa42.91■■■■■ 4.46
POLE2-201ENST00000216367 HMGXB3Q12766 1538 aa42.9■■■■■ 4.46
POLE2-201ENST00000216367 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
POLE2-201ENST00000216367 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
POLE2-201ENST00000216367 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
POLE2-201ENST00000216367 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.99■■■■■ 4.31
POLE2-201ENST00000216367 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.79■■■■■ 4.28
POLE2-201ENST00000216367 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.78■■■■■ 4.28
POLE2-201ENST00000216367 NESP48681 1621 aa41.75■■■■■ 4.27
POLE2-201ENST00000216367 CFTRP13569 1480 aa41.7■■■■■ 4.27
POLE2-201ENST00000216367 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.44■■■■■ 4.22
POLE2-201ENST00000216367 PRDM2Q13029 1718 aa41.44■■■■■ 4.22
POLE2-201ENST00000216367 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.3■■■■■ 4.2
POLE2-201ENST00000216367 ERCC6Q03468 1493 aa41.3■■■■■ 4.2
POLE2-201ENST00000216367 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.28■■■■■ 4.2
POLE2-201ENST00000216367 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.17■■■■■ 4.18
POLE2-201ENST00000216367 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
POLE2-201ENST00000216367 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.99■■■■■ 4.15
POLE2-201ENST00000216367 WDR62O43379 1518 aa40.89■■■■■ 4.14
POLE2-201ENST00000216367 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
POLE2-201ENST00000216367 ABCC8Q09428 1581 aa40.75■■■■■ 4.11
POLE2-201ENST00000216367 CUX2O14529 1486 aa40.74■■■■■ 4.11
POLE2-201ENST00000216367 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.73■■■■■ 4.11
POLE2-201ENST00000216367 TOPBP1Q92547 1522 aa40.71■■■■■ 4.11
POLE2-201ENST00000216367 CUX1P39880 1505 aa40.65■■■■■ 4.1
POLE2-201ENST00000216367 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
POLE2-201ENST00000216367 TOP2BQ02880 1626 aa40.47■■■■■ 4.07
POLE2-201ENST00000216367 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.47■■■■■ 4.07
POLE2-201ENST00000216367 SYNJ1O43426 1573 aa40.47■■■■■ 4.07
POLE2-201ENST00000216367 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
POLE2-201ENST00000216367 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.38■■■■■ 4.05
POLE2-201ENST00000216367 IFT140Q96RY7 1462 aa40.3■■■■■ 4.04
POLE2-201ENST00000216367 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
POLE2-201ENST00000216367 SOGA1O94964 1423 aa40.21■■■■■ 4.03
POLE2-201ENST00000216367 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.19■■■■■ 4.02
POLE2-201ENST00000216367 WDR97A6NE52 1622 aa40.09■■■■■ 4.01
POLE2-201ENST00000216367 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
POLE2-201ENST00000216367 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
POLE2-201ENST00000216367 TRIM41Q8WV44 630 aa39.95■■■■□ 3.99
POLE2-201ENST00000216367 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
POLE2-201ENST00000216367 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.91■■■■□ 3.98
POLE2-201ENST00000216367 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
POLE2-201ENST00000216367 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.88■■■■□ 3.971e-6■■□□□ 13
POLE2-201ENST00000216367 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.86■■■■□ 3.97
POLE2-201ENST00000216367 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.78■■■■□ 3.96
POLE2-201ENST00000216367 GRIN2BQ13224 1484 aa39.69■■■■□ 3.95
POLE2-201ENST00000216367 PBRM1Q86U86 1689 aa39.67■■■■□ 3.94
POLE2-201ENST00000216367 KIF27Q86VH2 1401 aa39.67■■■■□ 3.94
POLE2-201ENST00000216367 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.59■■■■□ 3.93
POLE2-201ENST00000216367 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
POLE2-201ENST00000216367 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.54■■■■□ 3.92
POLE2-201ENST00000216367 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.5■■■■□ 3.91
POLE2-201ENST00000216367 IGF1RP08069 1367 aa39.46■■■■□ 3.91
POLE2-201ENST00000216367 ADAMTS12P58397 1594 aa39.41■■■■□ 3.9
POLE2-201ENST00000216367 SYNJ2O15056 1496 aa39.38■■■■□ 3.89
POLE2-201ENST00000216367 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.35■■■■□ 3.89
POLE2-201ENST00000216367 EEA1Q15075 1411 aa39.35■■■■□ 3.89
POLE2-201ENST00000216367 CUL7Q14999 1698 aa39.34■■■■□ 3.89
POLE2-201ENST00000216367 CHD1O14646 1710 aa39.3■■■■□ 3.88
POLE2-201ENST00000216367 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
POLE2-201ENST00000216367 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.2■■■■□ 3.87
POLE2-201ENST00000216367 GRIN2AQ12879 1464 aa39.2■■■■□ 3.87
POLE2-201ENST00000216367 FBLN2P98095 1184 aa39.16■■■■□ 3.86
POLE2-201ENST00000216367 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.14■■■■□ 3.86
POLE2-201ENST00000216367 PRXQ9BXM0 1461 aa39.12■■■■□ 3.85
POLE2-201ENST00000216367 OSCARQ8IYS5 282 aa39.09■■■■□ 3.85
POLE2-201ENST00000216367 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.06■■■■□ 3.84
POLE2-201ENST00000216367 NUP160Q12769 1436 aa39.03■■■■□ 3.84
POLE2-201ENST00000216367 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
POLE2-201ENST00000216367 CEP170Q5SW79 1584 aa38.99■■■■□ 3.83
POLE2-201ENST00000216367 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.95■■■■□ 3.83
POLE2-201ENST00000216367 KIF21BO75037 1637 aa38.91■■■■□ 3.82
POLE2-201ENST00000216367 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.78■■■■□ 3.8
POLE2-201ENST00000216367 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.74■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms