RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370150.5

PNCK-204, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PNCK, Length 1,612 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCK-204ENST00000370150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.44■■■■■ 6.63
PNCK-204ENST00000370150 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.73■■■■■ 5.55
PNCK-204ENST00000370150 ABCC9O60706 1549 aa47.87■■■■■ 5.25
PNCK-204ENST00000370150 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
PNCK-204ENST00000370150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.82■■■■■ 5.09
PNCK-204ENST00000370150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.67■■■■■ 5.06
PNCK-204ENST00000370150 NACADO15069 1562 aa46.51■■■■■ 5.04
PNCK-204ENST00000370150 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.5■■■■■ 5.03
PNCK-204ENST00000370150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.35■■■■■ 5.01
PNCK-204ENST00000370150 SCRIBQ14160 1630 aa45.56■■■■■ 4.88
PNCK-204ENST00000370150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.47■■■■■ 4.87
PNCK-204ENST00000370150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.26■■■■■ 4.84
PNCK-204ENST00000370150 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.02■■■■■ 4.8
PNCK-204ENST00000370150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.91■■■■■ 4.781e-6■■■■□ 19.8
PNCK-204ENST00000370150 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.94■■■■■ 4.62
PNCK-204ENST00000370150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
PNCK-204ENST00000370150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
PNCK-204ENST00000370150 SMARCA4P51532 1647 aa43.62■■■■■ 4.57
PNCK-204ENST00000370150 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.57■■■■■ 4.57
PNCK-204ENST00000370150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
PNCK-204ENST00000370150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.33■■■■■ 4.53
PNCK-204ENST00000370150 WIZO95785 1651 aa43.17■■■■■ 4.5
PNCK-204ENST00000370150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.15■■■■■ 4.5
PNCK-204ENST00000370150 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.13■■■■■ 4.5
PNCK-204ENST00000370150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.13■■■■■ 4.49
PNCK-204ENST00000370150 SMARCA2P51531 1590 aa43.07■■■■■ 4.49
PNCK-204ENST00000370150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
PNCK-204ENST00000370150 NCAPD3P42695 1498 aa42.93■■■■■ 4.46
PNCK-204ENST00000370150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.44
PNCK-204ENST00000370150 HMGXB3Q12766 1538 aa42.8■■■■■ 4.44
PNCK-204ENST00000370150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
PNCK-204ENST00000370150 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.22■■■■■ 4.35
PNCK-204ENST00000370150 NESP48681 1621 aa41.73■■■■■ 4.27
PNCK-204ENST00000370150 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.73■■■■■ 4.27
PNCK-204ENST00000370150 CFTRP13569 1480 aa41.7■■■■■ 4.27
PNCK-204ENST00000370150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.64■■■■■ 4.26
PNCK-204ENST00000370150 PRDM2Q13029 1718 aa41.49■■■■■ 4.23
PNCK-204ENST00000370150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.31■■■■■ 4.2
PNCK-204ENST00000370150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.28■■■■■ 4.2
PNCK-204ENST00000370150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.26■■■■■ 4.2
PNCK-204ENST00000370150 ERCC6Q03468 1493 aa41.12■■■■■ 4.17
PNCK-204ENST00000370150 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.12■■■■■ 4.17
PNCK-204ENST00000370150 ABCC8Q09428 1581 aa41.02■■■■■ 4.16
PNCK-204ENST00000370150 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.87■■■■■ 4.13
PNCK-204ENST00000370150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
PNCK-204ENST00000370150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PNCK-204ENST00000370150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
PNCK-204ENST00000370150 CUX1P39880 1505 aa40.81■■■■■ 4.12
PNCK-204ENST00000370150 SYNJ1O43426 1573 aa40.77■■■■■ 4.12
PNCK-204ENST00000370150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.75■■■■■ 4.11
PNCK-204ENST00000370150 TOPBP1Q92547 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
PNCK-204ENST00000370150 WDR62O43379 1518 aa40.72■■■■■ 4.11
PNCK-204ENST00000370150 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.67■■■■■ 4.1
PNCK-204ENST00000370150 TOP2BQ02880 1626 aa40.67■■■■■ 4.1
PNCK-204ENST00000370150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.66■■■■■ 4.1
PNCK-204ENST00000370150 TRIM41Q8WV44 630 aa40.51■■■■■ 4.08
PNCK-204ENST00000370150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.5■■■■■ 4.07
PNCK-204ENST00000370150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
PNCK-204ENST00000370150 CUX2O14529 1486 aa40.37■■■■■ 4.05
PNCK-204ENST00000370150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.31■■■■■ 4.04
PNCK-204ENST00000370150 SOGA1O94964 1423 aa40.28■■■■■ 4.04
PNCK-204ENST00000370150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
PNCK-204ENST00000370150 IFT140Q96RY7 1462 aa40.2■■■■■ 4.03
PNCK-204ENST00000370150 WDR97A6NE52 1622 aa40.14■■■■■ 4.02
PNCK-204ENST00000370150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.13■■■■■ 4.01
PNCK-204ENST00000370150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
PNCK-204ENST00000370150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PNCK-204ENST00000370150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.94■■■■□ 3.98
PNCK-204ENST00000370150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.984e-8■■■■■ 27.4
PNCK-204ENST00000370150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.92■■■■□ 3.98
PNCK-204ENST00000370150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
PNCK-204ENST00000370150 KIF27Q86VH2 1401 aa39.88■■■■□ 3.97
PNCK-204ENST00000370150 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.84■■■■□ 3.97
PNCK-204ENST00000370150 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
PNCK-204ENST00000370150 PBRM1Q86U86 1689 aa39.75■■■■□ 3.95
PNCK-204ENST00000370150 EEA1Q15075 1411 aa39.69■■■■□ 3.94
PNCK-204ENST00000370150 GRIN2BQ13224 1484 aa39.68■■■■□ 3.94
PNCK-204ENST00000370150 IGF1RP08069 1367 aa39.66■■■■□ 3.94
PNCK-204ENST00000370150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
PNCK-204ENST00000370150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.57■■■■□ 3.92
PNCK-204ENST00000370150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.55■■■■□ 3.92
PNCK-204ENST00000370150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
PNCK-204ENST00000370150 CUL7Q14999 1698 aa39.47■■■■□ 3.91
PNCK-204ENST00000370150 ADAMTS12P58397 1594 aa39.46■■■■□ 3.91
PNCK-204ENST00000370150 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.42■■■■□ 3.9
PNCK-204ENST00000370150 PRXQ9BXM0 1461 aa39.39■■■■□ 3.9
PNCK-204ENST00000370150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.38■■■■□ 3.9
PNCK-204ENST00000370150 SYNJ2O15056 1496 aa39.32■■■■□ 3.89
PNCK-204ENST00000370150 KIF21BO75037 1637 aa39.29■■■■□ 3.88
PNCK-204ENST00000370150 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.28■■■■□ 3.88
PNCK-204ENST00000370150 CHD1O14646 1710 aa39.26■■■■□ 3.87
PNCK-204ENST00000370150 FBLN2P98095 1184 aa39.23■■■■□ 3.87
PNCK-204ENST00000370150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
PNCK-204ENST00000370150 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.22■■■■□ 3.87
PNCK-204ENST00000370150 GRIN2AQ12879 1464 aa39.21■■■■□ 3.87
PNCK-204ENST00000370150 GOLGA3Q08378 1498 aa39.11■■■■□ 3.85
PNCK-204ENST00000370150 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.07■■■■□ 3.85
PNCK-204ENST00000370150 CEP170Q5SW79 1584 aa39.02■■■■□ 3.84
PNCK-204ENST00000370150 NUP160Q12769 1436 aa38.98■■■■□ 3.83
PNCK-204ENST00000370150 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.8 ms