RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000350605.4

PYCARD-202, Transcript of PYD and CARD domain containing, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PYCARD, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYCARD-202ENST00000350605 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.31■■■■■ 6.6
PYCARD-202ENST00000350605 ABCC9O60706 1549 aa50.92■■■■■ 5.74
PYCARD-202ENST00000350605 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.65■■■■■ 5.7
PYCARD-202ENST00000350605 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.31■■■■■ 5.32
PYCARD-202ENST00000350605 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.98■■■■■ 5.27
PYCARD-202ENST00000350605 NACADO15069 1562 aa47.89■■■■■ 5.26
PYCARD-202ENST00000350605 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.69■■■■■ 5.22
PYCARD-202ENST00000350605 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.38■■■■■ 5.18
PYCARD-202ENST00000350605 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.37■■■■■ 5.17
PYCARD-202ENST00000350605 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.09■■■■■ 5.13
PYCARD-202ENST00000350605 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.97■■■■■ 5.11
PYCARD-202ENST00000350605 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
PYCARD-202ENST00000350605 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.43■■■■■ 5.02
PYCARD-202ENST00000350605 SCRIBQ14160 1630 aa46.21■■■■■ 4.99
PYCARD-202ENST00000350605 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.15■■■■■ 4.98
PYCARD-202ENST00000350605 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.99■■■■■ 4.95
PYCARD-202ENST00000350605 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.85■■■■■ 4.93
PYCARD-202ENST00000350605 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
PYCARD-202ENST00000350605 NCAPD3P42695 1498 aa44.2■■■■■ 4.67
PYCARD-202ENST00000350605 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.15■■■■■ 4.66
PYCARD-202ENST00000350605 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.07■■■■■ 4.65
PYCARD-202ENST00000350605 SMARCA4P51532 1647 aa44.02■■■■■ 4.64
PYCARD-202ENST00000350605 ERCC6Q03468 1493 aa43.95■■■■■ 4.63
PYCARD-202ENST00000350605 SMARCA2P51531 1590 aa43.92■■■■■ 4.62
PYCARD-202ENST00000350605 CUX2O14529 1486 aa43.89■■■■■ 4.62
PYCARD-202ENST00000350605 HMGXB3Q12766 1538 aa43.88■■■■■ 4.61
PYCARD-202ENST00000350605 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
PYCARD-202ENST00000350605 NESP48681 1621 aa43.7■■■■■ 4.59
PYCARD-202ENST00000350605 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
PYCARD-202ENST00000350605 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.53■■■■■ 4.56
PYCARD-202ENST00000350605 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.43■■■■■ 4.54
PYCARD-202ENST00000350605 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
PYCARD-202ENST00000350605 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.28■■■■■ 4.52
PYCARD-202ENST00000350605 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.17■■■■■ 4.5
PYCARD-202ENST00000350605 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.99■■■■■ 4.47
PYCARD-202ENST00000350605 WIZO95785 1651 aa42.95■■■■■ 4.47
PYCARD-202ENST00000350605 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.85■■■■■ 4.45
PYCARD-202ENST00000350605 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.68■■■■■ 4.42
PYCARD-202ENST00000350605 WDR62O43379 1518 aa42.59■■■■■ 4.41
PYCARD-202ENST00000350605 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.48■■■■■ 4.39
PYCARD-202ENST00000350605 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.41■■■■■ 4.38
PYCARD-202ENST00000350605 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PYCARD-202ENST00000350605 CFTRP13569 1480 aa42.32■■■■■ 4.37
PYCARD-202ENST00000350605 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
PYCARD-202ENST00000350605 TRIM41Q8WV44 630 aa42.21■■■■■ 4.35
PYCARD-202ENST00000350605 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PYCARD-202ENST00000350605 PRDM2Q13029 1718 aa42.01■■■■■ 4.32
PYCARD-202ENST00000350605 OSCARQ8IYS5 282 aa41.85■■■■■ 4.29
PYCARD-202ENST00000350605 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.85■■■■■ 4.29
PYCARD-202ENST00000350605 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
PYCARD-202ENST00000350605 IFT140Q96RY7 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
PYCARD-202ENST00000350605 TOPBP1Q92547 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
PYCARD-202ENST00000350605 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PYCARD-202ENST00000350605 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PYCARD-202ENST00000350605 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.44■■■■■ 4.22
PYCARD-202ENST00000350605 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.42■■■■■ 4.22
PYCARD-202ENST00000350605 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
PYCARD-202ENST00000350605 ABCC8Q09428 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
PYCARD-202ENST00000350605 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
PYCARD-202ENST00000350605 ARHGEF11O15085 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
PYCARD-202ENST00000350605 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.19
PYCARD-202ENST00000350605 CHD1O14646 1710 aa41.21■■■■■ 4.19
PYCARD-202ENST00000350605 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
PYCARD-202ENST00000350605 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.04■■■■■ 4.16
PYCARD-202ENST00000350605 FBLN2P98095 1184 aa41■■■■■ 4.15
PYCARD-202ENST00000350605 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.95■■■■■ 4.15
PYCARD-202ENST00000350605 SOGA1O94964 1423 aa40.94■■■■■ 4.14
PYCARD-202ENST00000350605 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
PYCARD-202ENST00000350605 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.88■■■■■ 4.13
PYCARD-202ENST00000350605 ARAP1Q96P48 1450 aa40.83■■■■■ 4.13
PYCARD-202ENST00000350605 CUX1P39880 1505 aa40.82■■■■■ 4.12
PYCARD-202ENST00000350605 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.79■■■■■ 4.12
PYCARD-202ENST00000350605 WDR97A6NE52 1622 aa40.74■■■■■ 4.11
PYCARD-202ENST00000350605 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.63■■■■■ 4.1
PYCARD-202ENST00000350605 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
PYCARD-202ENST00000350605 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
PYCARD-202ENST00000350605 GRIN2BQ13224 1484 aa40.6■■■■■ 4.09
PYCARD-202ENST00000350605 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
PYCARD-202ENST00000350605 SYNJ1O43426 1573 aa40.57■■■■■ 4.09
PYCARD-202ENST00000350605 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PYCARD-202ENST00000350605 PBRM1Q86U86 1689 aa40.55■■■■■ 4.08
PYCARD-202ENST00000350605 SYNJ2O15056 1496 aa40.5■■■■■ 4.07
PYCARD-202ENST00000350605 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.45■■■■■ 4.07
PYCARD-202ENST00000350605 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.37■■■■■ 4.05
PYCARD-202ENST00000350605 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.36■■■■■ 4.05
PYCARD-202ENST00000350605 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.13■■■■■ 4.01
PYCARD-202ENST00000350605 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.11■■■■■ 4.01
PYCARD-202ENST00000350605 GRIN2AQ12879 1464 aa40.1■■■■■ 4.01
PYCARD-202ENST00000350605 ADAMTS12P58397 1594 aa40.08■■■■■ 4.01
PYCARD-202ENST00000350605 TOP2BQ02880 1626 aa40.08■■■■■ 4.01
PYCARD-202ENST00000350605 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.06■■■■■ 4
PYCARD-202ENST00000350605 CEP170Q5SW79 1584 aa40.02■■■■■ 4
PYCARD-202ENST00000350605 NUP160Q12769 1436 aa39.95■■■■□ 3.99
PYCARD-202ENST00000350605 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.9■■■■□ 3.98
PYCARD-202ENST00000350605 SHROOM2Q13796 1616 aa39.85■■■■□ 3.97
PYCARD-202ENST00000350605 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.84■■■■□ 3.97
PYCARD-202ENST00000350605 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PYCARD-202ENST00000350605 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
PYCARD-202ENST00000350605 JPH4Q96JJ6 628 aa39.54■■■■□ 3.92
PYCARD-202ENST00000350605 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.53■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms