RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409611.1

AQP1-202, Transcript of aquaporin 1 (Colton blood group), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AQP1, Length 1,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP1-202ENST00000409611 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.02■■■■■ 6.56
AQP1-202ENST00000409611 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.63■■■■■ 5.53
AQP1-202ENST00000409611 ABCC9O60706 1549 aa48.21■■■■■ 5.31
AQP1-202ENST00000409611 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
AQP1-202ENST00000409611 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.62■■■■■ 5.05
AQP1-202ENST00000409611 NACADO15069 1562 aa46.59■■■■■ 5.05
AQP1-202ENST00000409611 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.55■■■■■ 5.04
AQP1-202ENST00000409611 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
AQP1-202ENST00000409611 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.38■■■■■ 5.02
AQP1-202ENST00000409611 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.4■■■■■ 4.86
AQP1-202ENST00000409611 SCRIBQ14160 1630 aa45.31■■■■■ 4.84
AQP1-202ENST00000409611 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.1■■■■■ 4.81
AQP1-202ENST00000409611 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.1■■■■■ 4.81
AQP1-202ENST00000409611 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
AQP1-202ENST00000409611 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
AQP1-202ENST00000409611 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.88■■■■■ 4.62
AQP1-202ENST00000409611 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.61■■■■■ 4.57
AQP1-202ENST00000409611 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.58■■■■■ 4.57
AQP1-202ENST00000409611 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
AQP1-202ENST00000409611 SMARCA4P51532 1647 aa43.37■■■■■ 4.53
AQP1-202ENST00000409611 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.16■■■■■ 4.5
AQP1-202ENST00000409611 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.06■■■■■ 4.48
AQP1-202ENST00000409611 SMARCA2P51531 1590 aa43.03■■■■■ 4.48
AQP1-202ENST00000409611 NCAPD3P42695 1498 aa42.99■■■■■ 4.47
AQP1-202ENST00000409611 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.96■■■■■ 4.47
AQP1-202ENST00000409611 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
AQP1-202ENST00000409611 HMGXB3Q12766 1538 aa42.81■■■■■ 4.44
AQP1-202ENST00000409611 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
AQP1-202ENST00000409611 WIZO95785 1651 aa42.7■■■■■ 4.43
AQP1-202ENST00000409611 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
AQP1-202ENST00000409611 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
AQP1-202ENST00000409611 NESP48681 1621 aa41.81■■■■■ 4.28
AQP1-202ENST00000409611 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.79■■■■■ 4.28
AQP1-202ENST00000409611 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.79■■■■■ 4.28
AQP1-202ENST00000409611 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.76■■■■■ 4.28
AQP1-202ENST00000409611 CFTRP13569 1480 aa41.6■■■■■ 4.25
AQP1-202ENST00000409611 ERCC6Q03468 1493 aa41.54■■■■■ 4.24
AQP1-202ENST00000409611 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.52■■■■■ 4.24
AQP1-202ENST00000409611 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.3■■■■■ 4.2
AQP1-202ENST00000409611 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.28■■■■■ 4.2
AQP1-202ENST00000409611 PRDM2Q13029 1718 aa41.24■■■■■ 4.19
AQP1-202ENST00000409611 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.2■■■■■ 4.19
AQP1-202ENST00000409611 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
AQP1-202ENST00000409611 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.07■■■■■ 4.16
AQP1-202ENST00000409611 CUX2O14529 1486 aa40.98■■■■■ 4.15
AQP1-202ENST00000409611 WDR62O43379 1518 aa40.91■■■■■ 4.14
AQP1-202ENST00000409611 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
AQP1-202ENST00000409611 ABCC8Q09428 1581 aa40.69■■■■■ 4.1
AQP1-202ENST00000409611 TOPBP1Q92547 1522 aa40.66■■■■■ 4.1
AQP1-202ENST00000409611 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.65■■■■■ 4.1
AQP1-202ENST00000409611 CUX1P39880 1505 aa40.48■■■■■ 4.07
AQP1-202ENST00000409611 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.05
AQP1-202ENST00000409611 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
AQP1-202ENST00000409611 IFT140Q96RY7 1462 aa40.32■■■■■ 4.05
AQP1-202ENST00000409611 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.29■■■■■ 4.04
AQP1-202ENST00000409611 SYNJ1O43426 1573 aa40.23■■■■■ 4.03
AQP1-202ENST00000409611 TOP2BQ02880 1626 aa40.23■■■■■ 4.03
AQP1-202ENST00000409611 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.21■■■■■ 4.03
AQP1-202ENST00000409611 SOGA1O94964 1423 aa40.17■■■■■ 4.02
AQP1-202ENST00000409611 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
AQP1-202ENST00000409611 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.14■■■■■ 4.02
AQP1-202ENST00000409611 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
AQP1-202ENST00000409611 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
AQP1-202ENST00000409611 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.93■■■■□ 3.98
AQP1-202ENST00000409611 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
AQP1-202ENST00000409611 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.986e-6■■■■□ 25.1
AQP1-202ENST00000409611 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
AQP1-202ENST00000409611 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.72■■■■□ 3.95
AQP1-202ENST00000409611 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.72■■■■□ 3.95
AQP1-202ENST00000409611 GRIN2BQ13224 1484 aa39.68■■■■□ 3.94
AQP1-202ENST00000409611 TRIM41Q8WV44 630 aa39.66■■■■□ 3.94
AQP1-202ENST00000409611 PBRM1Q86U86 1689 aa39.57■■■■□ 3.93
AQP1-202ENST00000409611 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.56■■■■□ 3.92
AQP1-202ENST00000409611 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
AQP1-202ENST00000409611 KIF27Q86VH2 1401 aa39.51■■■■□ 3.92
AQP1-202ENST00000409611 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.46■■■■□ 3.91
AQP1-202ENST00000409611 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.42■■■■□ 3.9
AQP1-202ENST00000409611 SYNJ2O15056 1496 aa39.37■■■■□ 3.89
AQP1-202ENST00000409611 FBLN2P98095 1184 aa39.35■■■■□ 3.89
AQP1-202ENST00000409611 OSCARQ8IYS5 282 aa39.33■■■■□ 3.89
AQP1-202ENST00000409611 CHD1O14646 1710 aa39.33■■■■□ 3.89
AQP1-202ENST00000409611 ADAMTS12P58397 1594 aa39.33■■■■□ 3.89
AQP1-202ENST00000409611 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
AQP1-202ENST00000409611 IGF1RP08069 1367 aa39.29■■■■□ 3.88
AQP1-202ENST00000409611 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.29■■■■□ 3.88
AQP1-202ENST00000409611 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.26■■■■□ 3.88
AQP1-202ENST00000409611 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.22■■■■□ 3.87
AQP1-202ENST00000409611 CUL7Q14999 1698 aa39.16■■■■□ 3.86
AQP1-202ENST00000409611 GRIN2AQ12879 1464 aa39.16■■■■□ 3.86
AQP1-202ENST00000409611 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.07■■■■□ 3.84
AQP1-202ENST00000409611 EEA1Q15075 1411 aa39.02■■■■□ 3.84
AQP1-202ENST00000409611 NUP160Q12769 1436 aa38.98■■■■□ 3.83
AQP1-202ENST00000409611 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.96■■■■□ 3.83
AQP1-202ENST00000409611 CEP170Q5SW79 1584 aa38.93■■■■□ 3.82
AQP1-202ENST00000409611 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.88■■■■□ 3.81
AQP1-202ENST00000409611 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.88■■■■□ 3.81
AQP1-202ENST00000409611 PRXQ9BXM0 1461 aa38.84■■■■□ 3.81
AQP1-202ENST00000409611 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
AQP1-202ENST00000409611 ARHGEF11O15085 1522 aa38.69■■■■□ 3.78
AQP1-202ENST00000409611 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms