RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630499.2

SRRM2-231, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM2, Length 1,207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-231	ENST00000630499	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.34	■■■■■ 6.61
SRRM2-231	ENST00000630499	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.62	■■■■■ 5.69
SRRM2-231	ENST00000630499	ABCC9	O60706	1549 aa		50.46	■■■■■ 5.67
SRRM2-231	ENST00000630499	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.09	■■■■■ 5.29
SRRM2-231	ENST00000630499	NACAD	O15069	1562 aa		47.79	■■■■■ 5.24
SRRM2-231	ENST00000630499	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		47.42	■■■■■ 5.18
SRRM2-231	ENST00000630499	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.22	■■■■■ 5.15
SRRM2-231	ENST00000630499	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.2	■■■■■ 5.15
SRRM2-231	ENST00000630499	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.15	■■■■■ 5.14
SRRM2-231	ENST00000630499	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.91	■■■■■ 5.1	3e-10	■■□□□ 13
SRRM2-231	ENST00000630499	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.83	■■■■■ 5.09
SRRM2-231	ENST00000630499	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.72	■■■■■ 5.07
SRRM2-231	ENST00000630499	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.61	■■■■■ 5.05
SRRM2-231	ENST00000630499	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.14	■■■■■ 4.98
SRRM2-231	ENST00000630499	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.01	■■■■■ 4.96
SRRM2-231	ENST00000630499	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.67	■■■■■ 4.9
SRRM2-231	ENST00000630499	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.59	■■■■■ 4.89
SRRM2-231	ENST00000630499	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.48	■■■■■ 4.87
SRRM2-231	ENST00000630499	NCAPD3	P42695	1498 aa		44.14	■■■■■ 4.66
SRRM2-231	ENST00000630499	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.98	■■■■■ 4.63
SRRM2-231	ENST00000630499	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.96	■■■■■ 4.63
SRRM2-231	ENST00000630499	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.84	■■■■■ 4.61
SRRM2-231	ENST00000630499	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.83	■■■■■ 4.61
SRRM2-231	ENST00000630499	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.7	■■■■■ 4.59
SRRM2-231	ENST00000630499	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.62	■■■■■ 4.57
SRRM2-231	ENST00000630499	CUX2	O14529	1486 aa		43.55	■■■■■ 4.56
SRRM2-231	ENST00000630499	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		43.49	■■■■■ 4.55
SRRM2-231	ENST00000630499	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.49	■■■■■ 4.55
SRRM2-231	ENST00000630499	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.49	■■■■■ 4.55
SRRM2-231	ENST00000630499	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.41	■■■■■ 4.54
SRRM2-231	ENST00000630499	NES	P48681	1621 aa		43.4	■■■■■ 4.54
SRRM2-231	ENST00000630499	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.13	■■■■■ 4.5
SRRM2-231	ENST00000630499	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
SRRM2-231	ENST00000630499	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SRRM2-231	ENST00000630499	WIZ	O95785	1651 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SRRM2-231	ENST00000630499	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SRRM2-231	ENST00000630499	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SRRM2-231	ENST00000630499	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
SRRM2-231	ENST00000630499	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SRRM2-231	ENST00000630499	WDR62	O43379	1518 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SRRM2-231	ENST00000630499	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
SRRM2-231	ENST00000630499	CFTR	P13569	1480 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SRRM2-231	ENST00000630499	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SRRM2-231	ENST00000630499	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SRRM2-231	ENST00000630499	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
SRRM2-231	ENST00000630499	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.95	■■■■■ 4.31
SRRM2-231	ENST00000630499	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.84	■■■■■ 4.29
SRRM2-231	ENST00000630499	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.48	■■■■■ 4.23
SRRM2-231	ENST00000630499	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.44	■■■■■ 4.22
SRRM2-231	ENST00000630499	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.43	■■■■■ 4.22
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.42	■■■■■ 4.22
SRRM2-231	ENST00000630499	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.4	■■■■■ 4.22
SRRM2-231	ENST00000630499	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.34	■■■■■ 4.21
SRRM2-231	ENST00000630499	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.33	■■■■■ 4.21
SRRM2-231	ENST00000630499	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.21	■■■■■ 4.19
SRRM2-231	ENST00000630499	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.19	■■■■■ 4.18
SRRM2-231	ENST00000630499	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
SRRM2-231	ENST00000630499	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.05	■■■■■ 4.16
SRRM2-231	ENST00000630499	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.05	■■■■■ 4.16
SRRM2-231	ENST00000630499	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		41.05	■■■■■ 4.16
SRRM2-231	ENST00000630499	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.99	■■■■■ 4.15	2e-9	■■■■□ 19.5
SRRM2-231	ENST00000630499	CHD1	O14646	1710 aa		40.91	■■■■■ 4.14
SRRM2-231	ENST00000630499	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.9	■■■■■ 4.14
SRRM2-231	ENST00000630499	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.87	■■■■■ 4.13
SRRM2-231	ENST00000630499	CUX1	P39880	1505 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SRRM2-231	ENST00000630499	SOGA1	O94964	1423 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SRRM2-231	ENST00000630499	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.77	■■■■■ 4.12
SRRM2-231	ENST00000630499	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.75	■■■■■ 4.11
SRRM2-231	ENST00000630499	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
SRRM2-231	ENST00000630499	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SRRM2-231	ENST00000630499	FBLN2	P98095	1184 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SRRM2-231	ENST00000630499	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SRRM2-231	ENST00000630499	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.5	■■■■■ 4.07
SRRM2-231	ENST00000630499	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.48	■■■■■ 4.07
SRRM2-231	ENST00000630499	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SRRM2-231	ENST00000630499	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SRRM2-231	ENST00000630499	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.39	■■■■■ 4.06
SRRM2-231	ENST00000630499	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SRRM2-231	ENST00000630499	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
SRRM2-231	ENST00000630499	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.35	■■■■■ 4.05
SRRM2-231	ENST00000630499	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.35	■■■■■ 4.05
SRRM2-231	ENST00000630499	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SRRM2-231	ENST00000630499	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.32	■■■■■ 4.05
SRRM2-231	ENST00000630499	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
SRRM2-231	ENST00000630499	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.18	■■■■■ 4.02
SRRM2-231	ENST00000630499	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.14	■■■■■ 4.02
SRRM2-231	ENST00000630499	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.09	■■■■■ 4.01
SRRM2-231	ENST00000630499	ADAMTS12	P58397	1594 aa		40.01	■■■■□ 3.99
SRRM2-231	ENST00000630499	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.98	■■■■□ 3.99
SRRM2-231	ENST00000630499	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
SRRM2-231	ENST00000630499	NUP160	Q12769	1436 aa		39.89	■■■■□ 3.98
SRRM2-231	ENST00000630499	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.89	■■■■□ 3.98
SRRM2-231	ENST00000630499	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.84	■■■■□ 3.97
SRRM2-231	ENST00000630499	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.83	■■■■□ 3.97
SRRM2-231	ENST00000630499	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.82	■■■■□ 3.96
SRRM2-231	ENST00000630499	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.78	■■■■□ 3.96
SRRM2-231	ENST00000630499	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.46	■■■■□ 3.91
SRRM2-231	ENST00000630499	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.4	■■■■□ 3.9
SRRM2-231	ENST00000630499	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.34	■■■■□ 3.89
SRRM2-231	ENST00000630499	IGF1R	P08069	1367 aa		39.29	■■■■□ 3.88

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