Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROB1E7EW31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROB1E7EW31 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROB1E7EW31 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms