RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.41■■■■■ 6.62
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.84■■■■■ 5.57
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCC9O60706 1549 aa47.87■■■■■ 5.25
SLC39A3-201ENST00000269740 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
SLC39A3-201ENST00000269740 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.77■■■■■ 5.08
SLC39A3-201ENST00000269740 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.74■■■■■ 5.07
SLC39A3-201ENST00000269740 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.68■■■■■ 5.06
SLC39A3-201ENST00000269740 NACADO15069 1562 aa46.65■■■■■ 5.06
SLC39A3-201ENST00000269740 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.49■■■■■ 5.03
SLC39A3-201ENST00000269740 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.46■■■■■ 4.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SCRIBQ14160 1630 aa45.45■■■■■ 4.87
SLC39A3-201ENST00000269740 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.02■■■■■ 4.8
SLC39A3-201ENST00000269740 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.95■■■■■ 4.79
SLC39A3-201ENST00000269740 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.85■■■■■ 4.77
SLC39A3-201ENST00000269740 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.8■■■■■ 4.6
SLC39A3-201ENST00000269740 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.78■■■■■ 4.6
SLC39A3-201ENST00000269740 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
SLC39A3-201ENST00000269740 SMARCA4P51532 1647 aa43.6■■■■■ 4.57
SLC39A3-201ENST00000269740 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.46■■■■■ 4.55
SLC39A3-201ENST00000269740 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.39■■■■■ 4.54
SLC39A3-201ENST00000269740 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
SLC39A3-201ENST00000269740 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.19■■■■■ 4.51
SLC39A3-201ENST00000269740 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.17■■■■■ 4.5
SLC39A3-201ENST00000269740 SMARCA2P51531 1590 aa43.17■■■■■ 4.5
SLC39A3-201ENST00000269740 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.14■■■■■ 4.5
SLC39A3-201ENST00000269740 WIZO95785 1651 aa43.05■■■■■ 4.48
SLC39A3-201ENST00000269740 NCAPD3P42695 1498 aa43.03■■■■■ 4.48
SLC39A3-201ENST00000269740 HMGXB3Q12766 1538 aa42.89■■■■■ 4.46
SLC39A3-201ENST00000269740 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
SLC39A3-201ENST00000269740 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
SLC39A3-201ENST00000269740 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
SLC39A3-201ENST00000269740 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.13■■■■■ 4.34
SLC39A3-201ENST00000269740 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.8■■■■■ 4.28
SLC39A3-201ENST00000269740 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.77■■■■■ 4.28
SLC39A3-201ENST00000269740 CFTRP13569 1480 aa41.74■■■■■ 4.27
SLC39A3-201ENST00000269740 NESP48681 1621 aa41.67■■■■■ 4.26
SLC39A3-201ENST00000269740 PRDM2Q13029 1718 aa41.54■■■■■ 4.24
SLC39A3-201ENST00000269740 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.45■■■■■ 4.23
SLC39A3-201ENST00000269740 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.3■■■■■ 4.2
SLC39A3-201ENST00000269740 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.25■■■■■ 4.19
SLC39A3-201ENST00000269740 ERCC6Q03468 1493 aa41.22■■■■■ 4.19
SLC39A3-201ENST00000269740 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC39A3-201ENST00000269740 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.95■■■■■ 4.15
SLC39A3-201ENST00000269740 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCC8Q09428 1581 aa40.85■■■■■ 4.13
SLC39A3-201ENST00000269740 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
SLC39A3-201ENST00000269740 WDR62O43379 1518 aa40.79■■■■■ 4.12
SLC39A3-201ENST00000269740 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.79■■■■■ 4.12
SLC39A3-201ENST00000269740 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.78■■■■■ 4.12
SLC39A3-201ENST00000269740 TOPBP1Q92547 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC39A3-201ENST00000269740 CUX1P39880 1505 aa40.72■■■■■ 4.11
SLC39A3-201ENST00000269740 TOP2BQ02880 1626 aa40.63■■■■■ 4.1
SLC39A3-201ENST00000269740 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.63■■■■■ 4.09
SLC39A3-201ENST00000269740 SYNJ1O43426 1573 aa40.62■■■■■ 4.09
SLC39A3-201ENST00000269740 CUX2O14529 1486 aa40.53■■■■■ 4.08
SLC39A3-201ENST00000269740 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.46■■■■■ 4.07
SLC39A3-201ENST00000269740 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
SLC39A3-201ENST00000269740 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIM41Q8WV44 630 aa40.39■■■■■ 4.06
SLC39A3-201ENST00000269740 SOGA1O94964 1423 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC39A3-201ENST00000269740 IFT140Q96RY7 1462 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC39A3-201ENST00000269740 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
SLC39A3-201ENST00000269740 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.23■■■■■ 4.03
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC39A3-201ENST00000269740 WDR97A6NE52 1622 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
SLC39A3-201ENST00000269740 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
SLC39A3-201ENST00000269740 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
SLC39A3-201ENST00000269740 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.89■■■■□ 3.98
SLC39A3-201ENST00000269740 KIF27Q86VH2 1401 aa39.89■■■■□ 3.98
SLC39A3-201ENST00000269740 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.89■■■■□ 3.985e-8■■□□□ 11.9
SLC39A3-201ENST00000269740 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.86■■■■□ 3.97
SLC39A3-201ENST00000269740 GRIN2BQ13224 1484 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC39A3-201ENST00000269740 PBRM1Q86U86 1689 aa39.73■■■■□ 3.95
SLC39A3-201ENST00000269740 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.71■■■■□ 3.95
SLC39A3-201ENST00000269740 EEA1Q15075 1411 aa39.71■■■■□ 3.95
SLC39A3-201ENST00000269740 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.69■■■■□ 3.94
SLC39A3-201ENST00000269740 IGF1RP08069 1367 aa39.61■■■■□ 3.93
SLC39A3-201ENST00000269740 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.92
SLC39A3-201ENST00000269740 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC39A3-201ENST00000269740 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.5■■■■□ 3.91
SLC39A3-201ENST00000269740 CUL7Q14999 1698 aa39.5■■■■□ 3.91
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
SLC39A3-201ENST00000269740 ADAMTS12P58397 1594 aa39.44■■■■□ 3.9
SLC39A3-201ENST00000269740 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.43■■■■□ 3.9
SLC39A3-201ENST00000269740 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.39■■■■□ 3.9
SLC39A3-201ENST00000269740 SYNJ2O15056 1496 aa39.39■■■■□ 3.9
SLC39A3-201ENST00000269740 PRXQ9BXM0 1461 aa39.32■■■■□ 3.89
SLC39A3-201ENST00000269740 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
SLC39A3-201ENST00000269740 CHD1O14646 1710 aa39.27■■■■□ 3.88
SLC39A3-201ENST00000269740 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.26■■■■□ 3.87
SLC39A3-201ENST00000269740 FBLN2P98095 1184 aa39.24■■■■□ 3.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GRIN2AQ12879 1464 aa39.23■■■■□ 3.87
SLC39A3-201ENST00000269740 KIF21BO75037 1637 aa39.2■■■■□ 3.87
SLC39A3-201ENST00000269740 NUP160Q12769 1436 aa39.03■■■■□ 3.84
SLC39A3-201ENST00000269740 GOLGA3Q08378 1498 aa39.02■■■■□ 3.84
SLC39A3-201ENST00000269740 OSCARQ8IYS5 282 aa39.01■■■■□ 3.84
SLC39A3-201ENST00000269740 CEP170Q5SW79 1584 aa38.98■■■■□ 3.83
SLC39A3-201ENST00000269740 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.87■■■■□ 3.81
SLC39A3-201ENST00000269740 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.87■■■■□ 3.81
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