RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409079.1

NGEF-203, Transcript of neuronal guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NGEF, Length 1,022 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGEF-203ENST00000409079 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54■■■■■ 6.24
NGEF-203ENST00000409079 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.18■■■■■ 5.3
NGEF-203ENST00000409079 ABCC9O60706 1549 aa47.86■■■■■ 5.25
NGEF-203ENST00000409079 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.71■■■■■ 4.91
NGEF-203ENST00000409079 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.57■■■■■ 4.89
NGEF-203ENST00000409079 NACADO15069 1562 aa45.51■■■■■ 4.88
NGEF-203ENST00000409079 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.01■■■■■ 4.8
NGEF-203ENST00000409079 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
NGEF-203ENST00000409079 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.71■■■■■ 4.75
NGEF-203ENST00000409079 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.6■■■■■ 4.73
NGEF-203ENST00000409079 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.6■■■■■ 4.73
NGEF-203ENST00000409079 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.55■■■■■ 4.72
NGEF-203ENST00000409079 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.34■■■■■ 4.69
NGEF-203ENST00000409079 SCRIBQ14160 1630 aa43.99■■■■■ 4.63
NGEF-203ENST00000409079 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.77■■■■■ 4.6
NGEF-203ENST00000409079 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
NGEF-203ENST00000409079 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.22■■■■■ 4.51
NGEF-203ENST00000409079 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
NGEF-203ENST00000409079 NCAPD3P42695 1498 aa42.04■■■■■ 4.32
NGEF-203ENST00000409079 SMARCA4P51532 1647 aa42■■■■■ 4.31
NGEF-203ENST00000409079 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.98■■■■■ 4.31
NGEF-203ENST00000409079 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
NGEF-203ENST00000409079 SMARCA2P51531 1590 aa41.86■■■■■ 4.29
NGEF-203ENST00000409079 HMGXB3Q12766 1538 aa41.71■■■■■ 4.27
NGEF-203ENST00000409079 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.63■■■■■ 4.25
NGEF-203ENST00000409079 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
NGEF-203ENST00000409079 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.57■■■■■ 4.25
NGEF-203ENST00000409079 ERCC6Q03468 1493 aa41.31■■■■■ 4.2
NGEF-203ENST00000409079 NESP48681 1621 aa41.23■■■■■ 4.19
NGEF-203ENST00000409079 WIZO95785 1651 aa41.13■■■■■ 4.17
NGEF-203ENST00000409079 CUX2O14529 1486 aa41.03■■■■■ 4.16
NGEF-203ENST00000409079 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.98■■■■■ 4.15
NGEF-203ENST00000409079 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
NGEF-203ENST00000409079 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.82■■■■■ 4.12
NGEF-203ENST00000409079 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.8■■■■■ 4.12
NGEF-203ENST00000409079 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.65■■■■■ 4.1
NGEF-203ENST00000409079 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
NGEF-203ENST00000409079 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
NGEF-203ENST00000409079 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.58■■■■■ 4.09
NGEF-203ENST00000409079 CFTRP13569 1480 aa40.41■■■■■ 4.06
NGEF-203ENST00000409079 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.38■■■■■ 4.05
NGEF-203ENST00000409079 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.32■■■■■ 4.05
NGEF-203ENST00000409079 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.32■■■■■ 4.04
NGEF-203ENST00000409079 WDR62O43379 1518 aa40.23■■■■■ 4.03
NGEF-203ENST00000409079 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.22■■■■■ 4.03
NGEF-203ENST00000409079 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
NGEF-203ENST00000409079 PRDM2Q13029 1718 aa39.93■■■■□ 3.98
NGEF-203ENST00000409079 TOPBP1Q92547 1522 aa39.6■■■■□ 3.93
NGEF-203ENST00000409079 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
NGEF-203ENST00000409079 ABCC8Q09428 1581 aa39.56■■■■□ 3.92
NGEF-203ENST00000409079 IFT140Q96RY7 1462 aa39.5■■■■□ 3.91
NGEF-203ENST00000409079 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.46■■■■□ 3.91
NGEF-203ENST00000409079 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
NGEF-203ENST00000409079 OSCARQ8IYS5 282 aa39.35■■■■□ 3.89
NGEF-203ENST00000409079 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
NGEF-203ENST00000409079 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
NGEF-203ENST00000409079 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
NGEF-203ENST00000409079 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.13■■■■□ 3.85
NGEF-203ENST00000409079 SOGA1O94964 1423 aa39.11■■■■□ 3.85
NGEF-203ENST00000409079 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.11■■■■□ 3.85
NGEF-203ENST00000409079 CUX1P39880 1505 aa39.07■■■■□ 3.84
NGEF-203ENST00000409079 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
NGEF-203ENST00000409079 TRIM41Q8WV44 630 aa39.03■■■■□ 3.84
NGEF-203ENST00000409079 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
NGEF-203ENST00000409079 FBLN2P98095 1184 aa38.87■■■■□ 3.81
NGEF-203ENST00000409079 WDR97A6NE52 1622 aa38.78■■■■□ 3.8
NGEF-203ENST00000409079 CHD1O14646 1710 aa38.75■■■■□ 3.79
NGEF-203ENST00000409079 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.7■■■■□ 3.79
NGEF-203ENST00000409079 GRIN2BQ13224 1484 aa38.68■■■■□ 3.78
NGEF-203ENST00000409079 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.65■■■■□ 3.78
NGEF-203ENST00000409079 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.65■■■■□ 3.78
NGEF-203ENST00000409079 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.65■■■■□ 3.78
NGEF-203ENST00000409079 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.63■■■■□ 3.78
NGEF-203ENST00000409079 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
NGEF-203ENST00000409079 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.62■■■■□ 3.77
NGEF-203ENST00000409079 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.61■■■■□ 3.77
NGEF-203ENST00000409079 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
NGEF-203ENST00000409079 ARHGEF11O15085 1522 aa38.6■■■■□ 3.77
NGEF-203ENST00000409079 TOP2BQ02880 1626 aa38.55■■■■□ 3.76
NGEF-203ENST00000409079 SYNJ1O43426 1573 aa38.52■■■■□ 3.76
NGEF-203ENST00000409079 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.52■■■■□ 3.76
NGEF-203ENST00000409079 SYNJ2O15056 1496 aa38.49■■■■□ 3.75
NGEF-203ENST00000409079 PBRM1Q86U86 1689 aa38.47■■■■□ 3.75
NGEF-203ENST00000409079 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.47■■■■□ 3.75
NGEF-203ENST00000409079 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.41■■■■□ 3.74
NGEF-203ENST00000409079 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
NGEF-203ENST00000409079 ARAP1Q96P48 1450 aa38.25■■■■□ 3.71
NGEF-203ENST00000409079 GRIN2AQ12879 1464 aa38.17■■■■□ 3.7
NGEF-203ENST00000409079 ADAMTS12P58397 1594 aa38.15■■■■□ 3.7
NGEF-203ENST00000409079 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.14■■■■□ 3.7
NGEF-203ENST00000409079 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.14■■■■□ 3.7
NGEF-203ENST00000409079 NUP160Q12769 1436 aa38.02■■■■□ 3.68
NGEF-203ENST00000409079 CEP170Q5SW79 1584 aa37.98■■■■□ 3.67
NGEF-203ENST00000409079 KIF27Q86VH2 1401 aa37.88■■■■□ 3.66
NGEF-203ENST00000409079 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
NGEF-203ENST00000409079 IGF1RP08069 1367 aa37.83■■■■□ 3.65
NGEF-203ENST00000409079 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.8■■■■□ 3.64
NGEF-203ENST00000409079 SHROOM2Q13796 1616 aa37.75■■■■□ 3.63
NGEF-203ENST00000409079 JPH4Q96JJ6 628 aa37.73■■■■□ 3.63
NGEF-203ENST00000409079 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
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