Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX1Q92499 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX1Q92499 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.6 ms