RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262197.7

RBFA-201, Transcript of ribosome binding factor A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFA, Length 1,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFA-201ENST00000262197 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.14■■■■■ 6.74
RBFA-201ENST00000262197 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.68■■■■■ 5.7
RBFA-201ENST00000262197 ABCC9O60706 1549 aa49.04■■■■■ 5.44
RBFA-201ENST00000262197 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
RBFA-201ENST00000262197 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.62■■■■■ 5.21
RBFA-201ENST00000262197 NACADO15069 1562 aa47.51■■■■■ 5.2
RBFA-201ENST00000262197 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.46■■■■■ 5.19
RBFA-201ENST00000262197 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.35■■■■■ 5.17
RBFA-201ENST00000262197 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.32■■■■■ 5.17
RBFA-201ENST00000262197 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.4■■■■■ 5.02
RBFA-201ENST00000262197 SCRIBQ14160 1630 aa46.24■■■■■ 4.99
RBFA-201ENST00000262197 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.88■■■■■ 4.94
RBFA-201ENST00000262197 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.94
RBFA-201ENST00000262197 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
RBFA-201ENST00000262197 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.75
RBFA-201ENST00000262197 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.43■■■■■ 4.7
RBFA-201ENST00000262197 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.41■■■■■ 4.7
RBFA-201ENST00000262197 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.4■■■■■ 4.7
RBFA-201ENST00000262197 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
RBFA-201ENST00000262197 SMARCA4P51532 1647 aa44.27■■■■■ 4.68
RBFA-201ENST00000262197 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
RBFA-201ENST00000262197 SMARCA2P51531 1590 aa43.92■■■■■ 4.62
RBFA-201ENST00000262197 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.86■■■■■ 4.61
RBFA-201ENST00000262197 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.8■■■■■ 4.6
RBFA-201ENST00000262197 NCAPD3P42695 1498 aa43.76■■■■■ 4.6
RBFA-201ENST00000262197 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
RBFA-201ENST00000262197 HMGXB3Q12766 1538 aa43.64■■■■■ 4.58
RBFA-201ENST00000262197 WIZO95785 1651 aa43.62■■■■■ 4.57
RBFA-201ENST00000262197 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
RBFA-201ENST00000262197 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
RBFA-201ENST00000262197 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
RBFA-201ENST00000262197 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.64■■■■■ 4.42
RBFA-201ENST00000262197 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.61■■■■■ 4.41
RBFA-201ENST00000262197 NESP48681 1621 aa42.53■■■■■ 4.4
RBFA-201ENST00000262197 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.53■■■■■ 4.4
RBFA-201ENST00000262197 CFTRP13569 1480 aa42.36■■■■■ 4.37
RBFA-201ENST00000262197 ERCC6Q03468 1493 aa42.31■■■■■ 4.36
RBFA-201ENST00000262197 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.31■■■■■ 4.36
RBFA-201ENST00000262197 PRDM2Q13029 1718 aa42.26■■■■■ 4.36
RBFA-201ENST00000262197 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.15■■■■■ 4.34
RBFA-201ENST00000262197 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.06■■■■■ 4.32
RBFA-201ENST00000262197 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.99■■■■■ 4.31
RBFA-201ENST00000262197 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
RBFA-201ENST00000262197 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.81■■■■■ 4.28
RBFA-201ENST00000262197 CUX2O14529 1486 aa41.66■■■■■ 4.26
RBFA-201ENST00000262197 WDR62O43379 1518 aa41.64■■■■■ 4.26
RBFA-201ENST00000262197 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
RBFA-201ENST00000262197 ABCC8Q09428 1581 aa41.54■■■■■ 4.24
RBFA-201ENST00000262197 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.46■■■■■ 4.23
RBFA-201ENST00000262197 TOPBP1Q92547 1522 aa41.44■■■■■ 4.22
RBFA-201ENST00000262197 CUX1P39880 1505 aa41.28■■■■■ 4.2
RBFA-201ENST00000262197 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.19
RBFA-201ENST00000262197 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.11■■■■■ 4.17
RBFA-201ENST00000262197 TOP2BQ02880 1626 aa41.11■■■■■ 4.17
RBFA-201ENST00000262197 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
RBFA-201ENST00000262197 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
RBFA-201ENST00000262197 IFT140Q96RY7 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
RBFA-201ENST00000262197 SYNJ1O43426 1573 aa41.08■■■■■ 4.17
RBFA-201ENST00000262197 SOGA1O94964 1423 aa40.97■■■■■ 4.15
RBFA-201ENST00000262197 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
RBFA-201ENST00000262197 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.9■■■■■ 4.14
RBFA-201ENST00000262197 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
RBFA-201ENST00000262197 WDR97A6NE52 1622 aa40.75■■■■■ 4.11
RBFA-201ENST00000262197 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.72■■■■■ 4.11
RBFA-201ENST00000262197 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
RBFA-201ENST00000262197 TRIM41Q8WV44 630 aa40.65■■■■■ 4.1
RBFA-201ENST00000262197 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
RBFA-201ENST00000262197 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.64■■■■■ 4.17e-10■■■■□ 26.4
RBFA-201ENST00000262197 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.52■■■■■ 4.08
RBFA-201ENST00000262197 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.51■■■■■ 4.08
RBFA-201ENST00000262197 PBRM1Q86U86 1689 aa40.47■■■■■ 4.07
RBFA-201ENST00000262197 GRIN2BQ13224 1484 aa40.45■■■■■ 4.07
RBFA-201ENST00000262197 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.38■■■■■ 4.05
RBFA-201ENST00000262197 KIF27Q86VH2 1401 aa40.37■■■■■ 4.05
RBFA-201ENST00000262197 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.3■■■■■ 4.04
RBFA-201ENST00000262197 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
RBFA-201ENST00000262197 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.27■■■■■ 4.04
RBFA-201ENST00000262197 CHD1O14646 1710 aa40.16■■■■■ 4.02
RBFA-201ENST00000262197 FBLN2P98095 1184 aa40.14■■■■■ 4.02
RBFA-201ENST00000262197 SYNJ2O15056 1496 aa40.13■■■■■ 4.01
RBFA-201ENST00000262197 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
RBFA-201ENST00000262197 ADAMTS12P58397 1594 aa40.1■■■■■ 4.01
RBFA-201ENST00000262197 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.07■■■■■ 4
RBFA-201ENST00000262197 CUL7Q14999 1698 aa40.06■■■■■ 4
RBFA-201ENST00000262197 IGF1RP08069 1367 aa40.06■■■■■ 4
RBFA-201ENST00000262197 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.03■■■■■ 4
RBFA-201ENST00000262197 OSCARQ8IYS5 282 aa40.03■■■■■ 4
RBFA-201ENST00000262197 EEA1Q15075 1411 aa39.95■■■■□ 3.99
RBFA-201ENST00000262197 GRIN2AQ12879 1464 aa39.91■■■■□ 3.98
RBFA-201ENST00000262197 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.89■■■■□ 3.98
RBFA-201ENST00000262197 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.78■■■■□ 3.96
RBFA-201ENST00000262197 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
RBFA-201ENST00000262197 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.74■■■■□ 3.95
RBFA-201ENST00000262197 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.73■■■■□ 3.95
RBFA-201ENST00000262197 NUP160Q12769 1436 aa39.68■■■■□ 3.94
RBFA-201ENST00000262197 CEP170Q5SW79 1584 aa39.67■■■■□ 3.94
RBFA-201ENST00000262197 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.65■■■■□ 3.94
RBFA-201ENST00000262197 PRXQ9BXM0 1461 aa39.64■■■■□ 3.94
RBFA-201ENST00000262197 KIF21BO75037 1637 aa39.47■■■■□ 3.91
RBFA-201ENST00000262197 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.46■■■■□ 3.91
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