Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.669e-9■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.739e-9■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.939e-9■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.39e-9■■■■■ 27.1
ILF3Q12906 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 27
ILF3Q12906 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 323.92■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 26.9
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ILF3Q12906 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 26.9
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ILF3Q12906 DDX19A-215ENST00000575878 1533 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CLPP-206ENST00000597326 480 ntTSL 513.25□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 26.9
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ILF3Q12906 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 AC012184.2-201ENST00000565116 565 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 DDX19A-210ENST00000567012 1178 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 AC012184.2-202ENST00000567706 867 ntTSL 58.89□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 MPHOSPH9-208ENST00000539024 3414 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.123e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 MPHOSPH9-209ENST00000539336 1090 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.1□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 26.9
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ILF3Q12906 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.752e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CHD9-204ENST00000561869 720 ntTSL 22.44□□□□□ -2.023e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CDK17-202ENST00000542666 1769 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CDK17-210ENST00000552262 566 ntTSL 310.65□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 26.9
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ILF3Q12906 CDK17-211ENST00000552496 583 ntTSL 37.94□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CDK17-209ENST00000551816 626 ntTSL 43.09□□□□□ -1.916e-7■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.165e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 25.28□□□□□ -1.565e-8■■■■■ 26.9
ILF3Q12906 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-210ENST00000473565 3208 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-207ENST00000461981 3173 ntTSL 25.56□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-202ENST00000409403 1664 ntTSL 55.01□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 CLK1-204ENST00000432425 1682 ntTSL 1 (best)3.38□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 MGRN1-208ENST00000587747 1898 ntTSL 516.49■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 MGRN1-204ENST00000536343 1575 ntTSL 215.83■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 26.8
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ILF3Q12906 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 26.8
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ILF3Q12906 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 26.8
ILF3Q12906 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 26.8
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ILF3Q12906 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.185e-9■■■■□ 26.7
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ILF3Q12906 AC010522.1-206ENST00000604231 576 ntTSL 412.12□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 26.7
ILF3Q12906 SLC35F5-212ENST00000498768 1711 ntTSL 1 (best)21.31■■□□□ 17e-14■■■■□ 26.7
ILF3Q12906 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.777e-14■■■■□ 26.7
ILF3Q12906 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.397e-14■■■■□ 26.7
ILF3Q12906 SLC35F5-202ENST00000409106 3120 ntTSL 214.93□□□□□ -0.027e-14■■■■□ 26.7
ILF3Q12906 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.517e-14■■■■□ 26.7
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ILF3Q12906 KCNJ15-213ENST00000547341 595 ntTSL 310.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 KCNJ15-216ENST00000549158 626 ntTSL 310.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 KCNJ15-219ENST00000551422 413 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 KCNJ15-214ENST00000547595 313 ntTSL 29.93□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 KCNJ15-218ENST00000549932 555 ntTSL 29.8□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 KCNJ15-215ENST00000548700 304 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 SND1-203ENST00000463020 793 ntTSL 215.64■□□□□ 0.094e-10■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 PPAT-205ENST00000510643 808 ntTSL 515.57■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 PPAT-204ENST00000507724 563 ntTSL 312.96□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 PPAT-201ENST00000264220 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.695e-12■■■■□ 26.6
ILF3Q12906 BBX-216ENST00000454540 392 ntTSL 520.35■□□□□ 0.856e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-215ENST00000449335 675 ntTSL 511.73□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-211ENST00000431630 601 ntTSL 411.73□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-217ENST00000456419 871 ntTSL 59.15□□□□□ -0.946e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-202ENST00000402163 1586 ntTSL 57.58□□□□□ -1.26e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.256e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-225ENST00000485939 555 ntTSL 46.34□□□□□ -1.396e-7■■■■□ 26.5
ILF3Q12906 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.56e-7■■■■□ 26.5
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