RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454540.5

BBX-216, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 5

Gene BBX, Length 392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-216ENST00000454540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.05■■■■■ 5.92
BBX-216ENST00000454540 ABCC9O60706 1549 aa47.78■■■■■ 5.24
BBX-216ENST00000454540 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.94■■■■■ 5.1
BBX-216ENST00000454540 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.6■■■■■ 4.89
BBX-216ENST00000454540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.08■■■■■ 4.81
BBX-216ENST00000454540 NACADO15069 1562 aa44.61■■■■■ 4.73
BBX-216ENST00000454540 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.43■■■■■ 4.7
BBX-216ENST00000454540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.32■■■■■ 4.69
BBX-216ENST00000454540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.04■■■■■ 4.64
BBX-216ENST00000454540 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.85■■■■■ 4.61
BBX-216ENST00000454540 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.74■■■■■ 4.59
BBX-216ENST00000454540 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.12■■■■■ 4.49
BBX-216ENST00000454540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.11■■■■■ 4.49
BBX-216ENST00000454540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.09■■■■■ 4.49
BBX-216ENST00000454540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
BBX-216ENST00000454540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.92■■■■■ 4.46
BBX-216ENST00000454540 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
BBX-216ENST00000454540 SCRIBQ14160 1630 aa42.78■■■■■ 4.44
BBX-216ENST00000454540 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.38■■■■■ 4.37
BBX-216ENST00000454540 CUX2O14529 1486 aa41.45■■■■■ 4.23
BBX-216ENST00000454540 ERCC6Q03468 1493 aa41.28■■■■■ 4.2
BBX-216ENST00000454540 NCAPD3P42695 1498 aa41.24■■■■■ 4.19
BBX-216ENST00000454540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.02■■■■■ 4.16
BBX-216ENST00000454540 NESP48681 1621 aa40.85■■■■■ 4.13
BBX-216ENST00000454540 HMGXB3Q12766 1538 aa40.81■■■■■ 4.12
BBX-216ENST00000454540 SMARCA2P51531 1590 aa40.8■■■■■ 4.12
BBX-216ENST00000454540 SMARCA4P51532 1647 aa40.73■■■■■ 4.11
BBX-216ENST00000454540 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
BBX-216ENST00000454540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
BBX-216ENST00000454540 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
BBX-216ENST00000454540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.37■■■■■ 4.05
BBX-216ENST00000454540 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.33■■■■■ 4.05
BBX-216ENST00000454540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.21■■■■■ 4.03
BBX-216ENST00000454540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.2■■■■■ 4.03
BBX-216ENST00000454540 TRIM41Q8WV44 630 aa40.19■■■■■ 4.02
BBX-216ENST00000454540 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.12■■■■■ 4.01
BBX-216ENST00000454540 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.97■■■■□ 3.99
BBX-216ENST00000454540 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.89■■■■□ 3.98
BBX-216ENST00000454540 WDR62O43379 1518 aa39.81■■■■□ 3.96
BBX-216ENST00000454540 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.57■■■■□ 3.93
BBX-216ENST00000454540 WIZO95785 1651 aa39.57■■■■□ 3.92
BBX-216ENST00000454540 OSCARQ8IYS5 282 aa39.5■■■■□ 3.91
BBX-216ENST00000454540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.49■■■■□ 3.91
BBX-216ENST00000454540 CFTRP13569 1480 aa39.33■■■■□ 3.89
BBX-216ENST00000454540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
BBX-216ENST00000454540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
BBX-216ENST00000454540 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39■■■■□ 3.83
BBX-216ENST00000454540 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39■■■■□ 3.83
BBX-216ENST00000454540 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39■■■■□ 3.83
BBX-216ENST00000454540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
BBX-216ENST00000454540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
BBX-216ENST00000454540 IFT140Q96RY7 1462 aa38.83■■■■□ 3.81
BBX-216ENST00000454540 ARHGEF11O15085 1522 aa38.82■■■■□ 3.8
BBX-216ENST00000454540 PRDM2Q13029 1718 aa38.74■■■■□ 3.79
BBX-216ENST00000454540 TOPBP1Q92547 1522 aa38.66■■■■□ 3.78
BBX-216ENST00000454540 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.65■■■■□ 3.78
BBX-216ENST00000454540 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.62■■■■□ 3.77
BBX-216ENST00000454540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
BBX-216ENST00000454540 ABCC8Q09428 1581 aa38.49■■■■□ 3.75
BBX-216ENST00000454540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.44■■■■□ 3.74
BBX-216ENST00000454540 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
BBX-216ENST00000454540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.41■■■■□ 3.74
BBX-216ENST00000454540 ARAP1Q96P48 1450 aa38.41■■■■□ 3.74
BBX-216ENST00000454540 CHD1O14646 1710 aa38.39■■■■□ 3.74
BBX-216ENST00000454540 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.34■■■■□ 3.73
BBX-216ENST00000454540 FBLN2P98095 1184 aa38.34■■■■□ 3.73
BBX-216ENST00000454540 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
BBX-216ENST00000454540 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.12■■■■□ 3.69
BBX-216ENST00000454540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
BBX-216ENST00000454540 SOGA1O94964 1423 aa38.05■■■■□ 3.68
BBX-216ENST00000454540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.99■■■■□ 3.67
BBX-216ENST00000454540 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.98■■■■□ 3.67
BBX-216ENST00000454540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
BBX-216ENST00000454540 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.87■■■■□ 3.65
BBX-216ENST00000454540 SYNJ1O43426 1573 aa37.85■■■■□ 3.65
BBX-216ENST00000454540 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
BBX-216ENST00000454540 WDR97A6NE52 1622 aa37.84■■■■□ 3.65
BBX-216ENST00000454540 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
BBX-216ENST00000454540 GRIN2BQ13224 1484 aa37.77■■■■□ 3.64
BBX-216ENST00000454540 SYNJ2O15056 1496 aa37.73■■■■□ 3.63
BBX-216ENST00000454540 CUX1P39880 1505 aa37.72■■■■□ 3.63
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BBX-216ENST00000454540 PBRM1Q86U86 1689 aa37.5■■■■□ 3.59
BBX-216ENST00000454540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.39■■■■□ 3.58
BBX-216ENST00000454540 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.37■■■■□ 3.57
BBX-216ENST00000454540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.36■■■■□ 3.57
BBX-216ENST00000454540 GRIN2AQ12879 1464 aa37.28■■■■□ 3.56
BBX-216ENST00000454540 CEP170Q5SW79 1584 aa37.22■■■■□ 3.55
BBX-216ENST00000454540 NUP160Q12769 1436 aa37.21■■■■□ 3.55
BBX-216ENST00000454540 ADAMTS12P58397 1594 aa37.14■■■■□ 3.54
BBX-216ENST00000454540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
BBX-216ENST00000454540 SHROOM2Q13796 1616 aa37.08■■■■□ 3.53
BBX-216ENST00000454540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.05■■■■□ 3.52
BBX-216ENST00000454540 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.99■■■■□ 3.51
BBX-216ENST00000454540 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
BBX-216ENST00000454540 JPH4Q96JJ6 628 aa36.88■■■■□ 3.49
BBX-216ENST00000454540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.88■■■■□ 3.49
BBX-216ENST00000454540 TOP2BQ02880 1626 aa36.87■■■■□ 3.49
BBX-216ENST00000454540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.86■■■■□ 3.49
BBX-216ENST00000454540 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.81■■■■□ 3.48
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